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TopHat2: accurate alignment of transcriptomes in the presence of insertions, deletions and gene fusions
TopHat2: accurate alignment of transcriptomes in the presence of insertions, deletions and gene fusions
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TopHat2: accurate alignment of transcriptomes in the presence of insertions, deletions and gene fusions

Kim, Daehwan ; Pertea, Geo ; Trapnell, Cole ; Pimentel, Harold ; Kelley, Ryan ; Salzberg, Steven L

Genome Biology (Online Edition), 2013-04, Vol.14 (4), p.R36-R36 [Periódico revisado por pares]

England: Springer-Verlag

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2
Structural basis for recognition of AT-rich DNA by unrelated xenogeneic silencing proteins
Structural basis for recognition of AT-rich DNA by unrelated xenogeneic silencing proteins
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Structural basis for recognition of AT-rich DNA by unrelated xenogeneic silencing proteins

Gordon, Blair R.G ; Li, Yifei ; Cote, Atina ; Weirauch, Matthew T ; Ding, Pengfei ; Hughes, Timothy R ; Navarre, William Wiley ; Xia, Bin ; Liu, Jun

Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2011-06, Vol.108 (26), p.10690-10695 [Periódico revisado por pares]

United States: National Academy of Sciences

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3
REAPR: a universal tool for genome assembly evaluation
REAPR: a universal tool for genome assembly evaluation
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REAPR: a universal tool for genome assembly evaluation

Hunt, Martin ; Kikuchi, Taisei ; Sanders, Mandy ; Newbold, Chris ; Berriman, Matthew ; Otto, Thomas D

Genome Biology (Online Edition), 2013-05, Vol.14 (5), p.R47-47 [Periódico revisado por pares]

England: Springer-Verlag

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4
Alignment-free genome comparison with feature frequency profiles (FFP) and optimal resolutions
Alignment-free genome comparison with feature frequency profiles (FFP) and optimal resolutions
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Alignment-free genome comparison with feature frequency profiles (FFP) and optimal resolutions

Sims, Gregory E ; Jun, Se-Ran ; Wu, Guohong A ; Kim, Sung-Hou

Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2009-02, Vol.106 (8), p.2677-2682 [Periódico revisado por pares]

United States: National Academy of Sciences

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5
Microbe domestication and the identification of the wild genetic stock of lager-brewing yeast
Microbe domestication and the identification of the wild genetic stock of lager-brewing yeast
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Microbe domestication and the identification of the wild genetic stock of lager-brewing yeast

Libkind, Diego ; Hittinger, Chris Todd ; Valério, Elisabete ; Gonçalves, Carla ; Dover, Jim ; Johnston, Mark ; Gonçalves, Paula ; Sampaio, José Paulo

Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2011-08, Vol.108 (35), p.14539-14544 [Periódico revisado por pares]

United States: National Academy of Sciences

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6
Reference-guided assembly of four diverse Arabidopsis thaliana genomes
Reference-guided assembly of four diverse Arabidopsis thaliana genomes
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Reference-guided assembly of four diverse Arabidopsis thaliana genomes

Schneeberger, Korbinian ; Ossowski, Stephan ; Ott, Felix ; Klein, Juliane D ; Wang, Xi ; Lanz, Christa ; Smith, Lisa M ; Cao, Jun ; Fitz, Joffrey ; Warthmann, Norman ; Henz, Stefan R ; Huson, Daniel H ; Weigel, Detlef

Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2011-06, Vol.108 (25), p.10249-10254 [Periódico revisado por pares]

United States: National Academy of Sciences

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7
Draft genome of the globally widespread and invasive Argentine ant (Linepithema humile)
Draft genome of the globally widespread and invasive Argentine ant (Linepithema humile)
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Draft genome of the globally widespread and invasive Argentine ant (Linepithema humile)

Smith, Christopher D ; Zimin, Aleksey ; Holt, Carson ; Abouheif, Ehab ; Benton, Richard ; Cash, Elizabeth ; Croset, Vincent ; Currie, Cameron R ; Elhaik, Eran ; Elsik, Christine G ; Fave, Marie-Julie ; Fernandes, Vilaiwan ; Gadau, Jürgen ; Gibson, Joshua D ; Graur, Dan ; Grubbs, Kirk J ; Hagen, Darren E ; Helmkampf, Martin ; Holley, Jo-Anne ; Hu, Hao ; Viniegra, Ana Sofia Ibarraran ; Johnson, Brian R ; Johnson, Reed M ; Khila, Abderrahman ; Kim, Jay W ; Laird, Joseph ; Mathis, Kaitlyn A ; Moeller, Joseph A ; Muñoz-Torres, Monica C ; Murphy, Marguerite C ; Nakamura, Rin ; Nigam, Surabhi ; Overson, Rick P ; Placek, Jennifer E ; Rajakumar, Rajendhran ; Reese, Justin T ; Robertson, Hugh M ; Smith, Chris R ; Suarez, Andrew V ; Suen, Garret ; Suhr, Elissa L ; Tao, Shu ; Torres, Candice W ; van Wilgenburg, Ellen ; Viljakainen, Lumi ; Walden, Kimberly K.O ; Wild, Alexander L ; Yandell, Mark ; Yorke, James A ; Tsutsui, Neil D

Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2011-04, Vol.108 (14), p.5673-5678 [Periódico revisado por pares]

United States: National Academy of Sciences

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8
Draft genome of the red harvester ant Pogonomyrmex barbatus
Draft genome of the red harvester ant Pogonomyrmex barbatus
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Draft genome of the red harvester ant Pogonomyrmex barbatus

Smith, Chris R ; Smith, Christopher D ; Robertson, Hugh M ; Helmkampf, Martin ; Zimin, Aleksey ; Yandell, Mark ; Holt, Carson ; Hu, Hao ; Abouheif, Ehab ; Benton, Richard ; Cash, Elizabeth ; Croset, Vincent ; Currie, Cameron R ; Elhaik, Eran ; Elsik, Christine G ; Favé, Marie-Julie ; Fernandes, Vilaiwan ; Gibson, Joshua D ; Graur, Dan ; Gronenberg, Wulfila ; Grubbs, Kirk J ; Hagen, Darren E ; Viniegra, Ana Sofia Ibarraran ; Johnson, Brian R ; Johnson, Reed M ; Khila, Abderrahman ; Kim, Jay W ; Mathis, Kaitlyn A ; Munoz-Torres, Monica C ; Murphy, Marguerite C ; Mustard, Julie A ; Nakamura, Rin ; Niehuis, Oliver ; Nigam, Surabhi ; Overson, Rick P ; Placek, Jennifer E ; Rajakumar, Rajendhran ; Reese, Justin T ; Suen, Garret ; Tao, Shu ; Torres, Candice W ; Tsutsui, Neil D ; Viljakainen, Lumi ; Wolschin, Florian ; Gadau, Jürgen

Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2011-04, Vol.108 (14), p.5667-5672 [Periódico revisado por pares]

United States: National Academy of Sciences

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9
Genome sequence of the pea aphid Acyrthosiphon pisum
Genome sequence of the pea aphid Acyrthosiphon pisum
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Genome sequence of the pea aphid Acyrthosiphon pisum

Richards, Stephen ; Gibbs, Richard A ; Gerardo, Nicole M ; Moran, Nancy ; Nakabachi, Atsushi ; Stern, David ; Tagu, Denis ; Wilson, Alex C.C ; Dang, Phat M ; Souvorov, Alexandre ; Evans, Jay ; Hunter, Wayne Eisen, Jonathan A.

PLoS Biology, 2010-02, Vol.8 (2), p.e1000313-e1000313 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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10
Genetic evidence for archaic admixture in Africa
Genetic evidence for archaic admixture in Africa
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Genetic evidence for archaic admixture in Africa

Hammer, Michael F ; Woerner, August E ; Mendez, Fernando L ; Watkins, Joseph C ; Wall, Jeffrey D

Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2011-09, Vol.108 (37), p.15123-15128 [Periódico revisado por pares]

United States: National Academy of Sciences

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