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Estudo por simulação computacional em larga escala da complexação de proteínas do leite

Delboni, Lariani Aparecida

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Bioinformática 2017-01-24

Acesso online. A biblioteca também possui exemplares impressos.

  • Título:
    Estudo por simulação computacional em larga escala da complexação de proteínas do leite
  • Autor: Delboni, Lariani Aparecida
  • Orientador: Silva, Fernando Luis Barroso da
  • Assuntos: Complexação; Proteínas Do Soro Do Leite; Monte Carlo; Correlação De Cargas Em Proteínas; Energia Livre; Modelo Do Solvente Contínuo; Charge Correlations In Proteins; Free Energy; Continuum Solvent Model; Complexation; Whey Proteins
  • Notas: Dissertação (Mestrado)
  • Notas Locais: Programa Interunidades de Pós-graduação em Bioinformática
  • Descrição: A estrutura e o comportamento de proteínas são de grande interesse a uma infinidade de áreas de conhecimento, com especial destaque para alimentação e saúde. As proteínas compõem uma fundamental classe de moléculas biológicas, com capacidade para interagir com diversas outras estruturas e formar complexos. Dois tópicos principais são abordados neste trabalho: (a) avaliação da formação de complexos entre três proteínas do soro do leite (-lactoalbumina, -lactoglobulina e lactoferrina) em diferentes condições experimentais de força iônica e pH da solução através de derivadas da energia livre e (b) avaliação de aspectos relacionados com a fundamentação teórica dos modelos moleculares com granularidade grossa e uso do dielétrico contínuo empregados para estudo do fenômeno da complexação molecular, através da análise, em larga escala, da correlação de cargas em proteínas disponíveis no banco de dados de proteínas. Os estudos teóricos de complexação foram realizados através do emprego de simulações Monte Carlo Metropolis, com o modelo do solvente contínuo, constante dielétrica homogênea e sal implicitamente descrito. Os estudos de complexação permitem compreender os mecanismos moleculares envolvidos, elucidando, inclusive, controvérsias experimentais e oferecendo orientação para aplicações. Já os resultados do estudo de correlação de cargas em estruturas experimentais de proteínas permitem justificar as aproximações do modelo.
  • DOI: 10.11606/D.95.2017.tde-24022017-230810
  • Editor: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Bioinformática
  • Data de criação/publicação: 2017-01-24
  • Formato: Adobe PDF
  • Idioma: Português

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