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Inovações em técnicas de alinhamentos múltiplos e predições de genes

Onuchic, Vitor Ferreira

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Bioinformática 2012-10-05

Acesso online. A biblioteca também possui exemplares impressos.

  • Título:
    Inovações em técnicas de alinhamentos múltiplos e predições de genes
  • Autor: Onuchic, Vitor Ferreira
  • Orientador: Durham, Alan Mitchell
  • Assuntos: Bioinformática
  • Notas: Dissertação (Mestrado)
  • Notas Locais: Programa Interunidades de Pós-graduação em Bioinformática
  • Descrição: Neste trabalho foram abordados dois problemas: alinhamento de sequências e predição de genes. Estes dois problemas, apesar de serem distintos, tem grande relação entre si. Assim, uma proposta deste trabalho foi uma técnica, baseada em transformações de consistência, que permite a integração entre os modelos pair HMM (utilizado para alinhamento entre pares de sequências) e GHMM (utilizado em predição de genes), de maneira que as predições de genes para um conjunto de sequências genômicas sejam consistentes com o alinhamento entre essas sequências. Além disso, apresentamos dois novos algoritmos relacionados à predição de genes utilizando GHMMs
  • DOI: 10.11606/D.95.2012.tde-20230725-114557
  • Editor: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Bioinformática
  • Data de criação/publicação: 2012-10-05
  • Formato: Adobe PDF
  • Idioma: Português

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