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Análise Comparativa de Regiões Anômalas entre os Genomas

R. K. Dalla Valle A. T. M Ramos; J. R Ottoni; Luís Eduardo Aranha Camargo; D. D Rosa; M. M Zerillo; C. B. M Vitorello; Simpósio Internacional de Iniciação Cientifica da Universidade de São Paulo (12. 2004 Piracicaba, SP)

Agropecuária; resumos São Paulo : USP, 2004

São Paulo USP 2004

Localização: ESALQ - Biblioteca Central    (CD E 757 12/2004 1430857 ) e outros locais(Acessar)

  • Título:
    Análise Comparativa de Regiões Anômalas entre os Genomas
  • Autor: R. K. Dalla Valle
  • A. T. M Ramos; J. R Ottoni; Luís Eduardo Aranha Camargo; D. D Rosa; M. M Zerillo; C. B. M Vitorello; Simpósio Internacional de Iniciação Cientifica da Universidade de São Paulo (12. 2004 Piracicaba, SP)
  • Assuntos: GENOMAS
  • É parte de: Agropecuária; resumos São Paulo : USP, 2004
  • Notas: Disponivel também em http://www.usp.br/siicusp
  • Descrição: Realizar um estudo de regiões diferencialmente organizadas no genoma de Lxc quando comparadas ao genoma completamente sequenciado de Lxx. > Material e/ou métodos: < As sequências de alguns insertos clonados em BAC do genoma de Lxc quando mapeados no genoma de Lxx apresentaram incoerência quanto ao tamanho real e posicionamento de suas extremidades. Foram realizadas sub-bibliotecas em plasmídeo e sequenciamento total dos insertos. As sequências resultantes foram comparadas com banco de dados de Lxx e outros organismos (www.ncbi.nlm.nih.gov). Ferramentas de bioinformática (phred/Phrap/Consed) foram utilizadas para a construção de um mapa virtual da região. > Resultados: < A análise do sequenciamento e formação de sequências consenso (contigs) permitiram o mapeamento virtual dos clones no genoma de Lxx caracterizando as diferenças entre as duas bactérias fitopatogênicas. > Conclusões: < As regiões analisadas representam fragmentos com uma organizacao diferencial no cromossomo das bactérias, e que podem ter sido ocasionados pela presença de fagos, transposons do tipo IS e transferência lateral de genes
  • Editor: São Paulo USP
  • Data de criação/publicação: 2004
  • Formato: CD-ROM.
  • Idioma: Português
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