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Análise de dados de expressão gênica: normalização de microarrays e modelagem de redes regulatórias

Fujita, André

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Bioinformática 2007-08-10

Acesso online. A biblioteca também possui exemplares impressos.

  • Título:
    Análise de dados de expressão gênica: normalização de microarrays e modelagem de redes regulatórias
  • Autor: Fujita, André
  • Orientador: Ferreira, Carlos Eduardo; Sogayar, Mari Cleide
  • Assuntos: Var; Svar; Redes Regulatórias; Normalização De Microarrays De Dna; Microarray; Gedi; Dvar; Regulatory Networks; Var; Dna Microarray Data Normalization
  • Notas: Tese (Doutorado)
  • Notas Locais: Programa Interunidades de Pós-graduação em Bioinformática
  • Descrição: A análise da expressão gênica através de dados gerados em experimentos de microarrays de DNA vem possibilitando uma melhor compreensão da dinâmica e dos mecanismos envolvidos nos processos celulares ao nível molecular. O aprimoramento desta análise é crucial para o avanço do conhecimento sobre as bases moleculares das neoplasias e para a identificação de marcadores moleculares para uso em diagnóstico, desenho de novos medicamentos em terapias anti-tumorais. Este trabalho tem como objetivos o desenvolvimento de modelos de análise desses dados, propondo uma nova forma de normalização de dados provenientes de microarrays e dois modelos para a construção de redes regulatórias de expressão gênica, sendo uma baseada na conectividade dinâmica entre diversos genes ao longo do ciclo celular e a outra que resolve o problema da dimensionalidade, em que o número de experimentos de microarrays é menor que o número de genes. Apresenta-se, ainda, um pacote de ferramentas com uma interface gráfica de fácil uso contendo diversas técnicas de análise de dados já conhecidas como também as abordagens propostas neste trabalho.
  • DOI: 10.11606/T.95.2007.tde-14092007-173758
  • Editor: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Bioinformática
  • Data de criação/publicação: 2007-08-10
  • Formato: Adobe PDF
  • Idioma: Português
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