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From genome to function by studying eQTLs

Westra, Harm-Jan ; Franke, Lude

BBA - Molecular Basis of Disease, October 2014, Vol.1842(10), pp.1896-1902 [Periódico revisado por pares]

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Hemani et al. reply

Gibran Hemani ; Konstantin Shakhbazov ; Harm-Jan Westra ; Tonu Esko ; Anjali K. Henders ; Allan F. Mcrae ; Jian Yang ; Greg Gibson ; Nicholas G. Martin ; Andres Metspalu ; Lude Franke ; Grant W. Montgomery ; Peter M. Visscher ; Joseph E. Powell

Nature, 2014, Vol.514(7520), p.E5 [Periódico revisado por pares]

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Detection and replication of epistasis influencing transcription in humans

Gibran Hemani ; Konstantin Shakhbazov ; Harm-Jan Westra ; Tonu Esko ; Anjali K. Henders ; Allan F. Mcrae ; Jian Yang ; Greg Gibson ; Nicholas G. Martin ; Andres Metspalu ; Lude Franke ; Grant W. Montgomery ; Peter M. Visscher ; Joseph E. Powell

Nature, 2014, Vol.508(7495), p.249 [Periódico revisado por pares]

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reGenotyper: Detecting mislabeled samples in genetic data

Zych, Konrad ; Snoek, Basten L. ; Elvin, Mark ; Rodriguez, Miriam ; Van Der Velde, K. Joeri ; Arends, Danny ; Westra, Harm-Jan ; Swertz, Morris A. ; Poulin, Gino ; Kammenga, Jan E. ; Breitling, Rainer ; Jansen, Ritsert C. ; Li, Yang

Zych, K., B. L. Snoek, M. Elvin, M. Rodriguez, K. J. Van der Velde, D. Arends, H. Westra, et al. 2017. “reGenotyper: Detecting mislabeled samples in genetic data.” PLoS ONE 12 (2): e0171324. doi:10.1371/journal.pone.0171324. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0171324. [Periódico revisado por pares]

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A Genome-Wide Association Study of Circulating Galectin-3 (Genome-Wide Association Study of Galectin-3)

de Boer, Rudolf A ; Verweij, Niek ; van Veldhuisen, Dirk J ; Westra, Harm-Jan ; Bakker, Stephan J. L ; Gansevoort, Ron T ; Muller Kobold, Anneke C ; van Gilst, Wiek H ; Franke, Lude ; Leach, Irene Mateo ; van der Harst, Pim Yao, Yong-gang (Editor)

2012, Vol.7(10), p.e47385 [Periódico revisado por pares]

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Gene expression analysis identifies global gene dosage sensitivity in cancer

Rudolf S N Fehrmann ; Juha M Karjalainen ; Małgorzata Krajewska ; Harm-Jan Westra ; David Maloney ; Anton Simeonov ; Tune H Pers ; Joel N Hirschhorn ; Ritsert C Jansen ; Erik A Schultes ; Herman H H B M Van Haagen ; Elisabeth G E De Vries ; Gerard J Te Meerman ; Cisca Wijmenga ; Marcel A T M Van Vugt ; Lude Franke

Nature Genetics, 2015, Vol.47(2), p.115 [Periódico revisado por pares]

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Detection and replication of epistasis influencing transcription in humans

Hemani, Gibran ; Shakhbazov, Konstantin ; Westra, Harm-Jan ; Esko, Tonu ; Henders, Anjali K ; Mcrae, Allan F ; Yang, Jian ; Gibson, Greg ; Martin, Nicholas G ; Metspalu, Andres ; Franke, Lude ; Montgomery, Grant W ; Visscher, Peter M ; Powell, Joseph E

Nature, 10 April 2014, Vol.508(7495), pp.249-53 [Periódico revisado por pares]

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Genetics of rheumatoid arthritis contributes to biology and drug discovery

Okada, Yukinori ; Wu, Di ; Trynka, Gosia ; Raj, Towfique ; Terao, Chikashi ; Ikari, Katsunori ; Kochi, Yuta ; Ohmura, Koichiro ; Suzuki, Akari ; Yoshida, Shinji ; Graham, Robert R. ; Manoharan, Arun ; Ortmann, Ward ; Bhangale, Tushar ; Denny, Joshua C. ; Carroll, Robert J. ; Eyler, Anne E. ; Greenberg, Jeffrey D. ; Kremer, Joel M. ; Pappas, Dimitrios A. ; Jiang, Lei ; Yin, Jian ; Ye, Lingying ; Su, Ding-Feng ; Yang, Jian ; Xie, Gang ; Keystone, Ed ; Westra, Harm-Jan ; Esko, Tõnu ; Metspalu, Andres ; Zhou, Xuezhong ; Gupta, Namrata ; Mirel, Daniel ; Stahl, Eli A. ; Diogo, Dorothée ; Cui, Jing ; Liao, Katherine ; Guo, Michael H. ; Myouzen, Keiko ; Kawaguchi, Takahisa ; Coenen, Marieke J.H. ; Van Riel, Piet L.C.M. ; Van De Laar, Mart A.F.J. ; Guchelaar, Henk-Jan ; Huizinga, Tom W.J. ; Dieudé, Philippe ; Mariette, Xavier ; Bridges, S. Louis ; Zhernakova, Alexandra ; Toes, Rene E.M. ; Tak, Paul P. ; Miceli-Richard, Corinne ; Bang, So-Young ; Lee, Hye-Soon ; Martin, Javier ; Gonzalez-Gay, Miguel A. ; Rodriguez-Rodriguez, Luis ; Rantapää-Dahlqvist, Solbritt ; Ärlestig, Lisbeth ; Choi, Hyon K. ; Kamatani, Yoichiro ; Galan, Pilar ; Lathrop, Mark ; Eyre, Steve ; Bowes, John ; Barton, Anne ; De Vries, Niek ; Moreland, Larry W. ; Criswell, Lindsey A. ; Karlson, Elizabeth W. ; Taniguchi, Atsuo ; Yamada, Ryo ; Kubo, Michiaki ; Liu, Jun S. ; Bae, Sang-Cheol ; Worthington, Jane ; Padyukov, Leonid ; Klareskog, Lars ; Gregersen, Peter K. ; Raychaudhuri, Soumya ; Stranger, Barbara E. ; De Jager, Philip L. ; Franke, Lude ; Visscher, Peter M. ; Brown, Matthew A. ; Yamanaka, Hisashi ; Mimori, Tsuneyo ; Takahashi, Atsushi ; Xu, Huji ; Behrens, Timothy W. ; Siminovitch, Katherine A. ; Momohara, Shigeki ; Matsuda, Fumihiko ; Yamamoto, Kazuhiko ; Plenge, Robert M.

Okada, Y., D. Wu, G. Trynka, T. Raj, C. Terao, K. Ikari, Y. Kochi, et al. 2013. “Genetics of rheumatoid arthritis contributes to biology and drug discovery.” Nature 506 (7488): 376-381. doi:10.1038/nature12873. http://dx.doi.org/10.1038/nature12873. [Periódico revisado por pares]

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SMIM1 underlies the Vel blood group and influences red blood cell traits

Ana Cvejic ; Lonneke Haer-Wigman ; Jonathan C Stephens ; Myrto Kostadima ; Peter A Smethurst ; Mattia Frontini ; Emile Van Den Akker ; Paul Bertone ; Ewa Bielczyk-Maczyńska ; Samantha Farrow ; Rudolf S N Fehrmann ; Alan Gray ; Masja De Haas ; Vincent G Haver ; Gregory Jordan ; Juha Karjalainen ; Hindrik H D Kerstens ; Graham Kiddle ; Heather Lloyd-Jones ; Malcolm Needs ; Joyce Poole ; Aicha Ait Soussan ; Augusto Rendon ; Klaus Rieneck ; Jennifer G Sambrook ; Hein Schepers ; Herman H W Silljé ; Botond Sipos ; Dorine Swinkels ; Asif U Tamuri ; Niek Verweij ; Nicholas A Watkins ; Harm-Jan Westra ; Derek Stemple ; Lude Franke ; Nicole Soranzo ; Hendrik G Stunnenberg ; Nick Goldman ; Pim Van Der Harst ; C Ellen Van Der Schoot ; Willem H Ouwehand ; Cornelis A Albers

Nature Genetics, 2013, Vol.45(5), p.542 [Periódico revisado por pares]

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High density genetic mapping identifies new susceptibility loci for rheumatoid arthritis

Eyre, Steve ; Bowes, John ; Diogo, Dorothée ; Lee, Annette ; Barton, Anne ; Martin, Paul ; Zhernakova, Alexandra ; Stahl, Eli ; Viatte, Sebastien ; Mcallister, Kate ; Amos, Christopher I. ; Padyukov, Leonid ; Toes, Rene E.M. ; Huizinga, Tom W.J. ; Wijmenga, Cisca ; Trynka, Gosia ; Franke, Lude ; Westra, Harm-Jan ; Alfredsson, Lars ; Hu, Xinli ; Sandor, Cynthia ; De Bakker, Paul I.W. ; Davila, Sonia ; Khor, Chiea Chuen ; Heng, Khai Koon ; Andrews, Robert ; Edkins, Sarah ; Hunt, Sarah E ; Langford, Cordelia ; Symmons, Deborah ; Concannon, Pat ; Onengut-Gumuscu, Suna ; Rich, Stephen S ; Deloukas, Panos ; Gonzalez-Gay, Miguel A. ; Rodriguez-Rodriguez, Luis ; Ärlsetig, Lisbeth ; Martin, Javier ; Rantapää-Dahlqvist, Solbritt ; Plenge, Robert ; Raychaudhuri, Soumya ; Klareskog, Lars ; Gregersen, Peter K ; Worthington, Jane

Eyre, S., J. Bowes, D. Diogo, A. Lee, A. Barton, P. Martin, A. Zhernakova, et al. 2012. “High density genetic mapping identifies new susceptibility loci for rheumatoid arthritis.” Nature genetics 44 (12): 1336-1340. doi:10.1038/ng.2462. http://dx.doi.org/10.1038/ng.2462. [Periódico revisado por pares]

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