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Earth BioGenome Project sequencing life for the future of life

Harris A. Lewin Gene E Robinson; W. John Kress; William J Baker; Jonathan Coddington; Keith A Crandall; Richard Durbin; Scott V Edwards; Félix Forest; M. Thomas P Gilbert; Melissa M Goldstein; Igor V Grigoriev; Kevin J Hackett; David Haussler; Erich D Jarvis; Warren E Johnson; Aristides Patrinos; Stephen Richards; Juan Carlos Castilla-Rubio; Marie-Anne Van Sluys; Pamela S Soltis; Xun Xu; Huanming Yang; Guojie Zhang

Proceedisngs National Academy of Sciences of the United States of America - PNAS Washington v. 115, n. 17, p. 4325-4333, Apr. 2018

Washington 2018

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Comparative Genomics Reveals High Biological Diversity And Specific Adaptations In The Industrially And Medically Important Fungal Genus Aspergillus

De Vries; Ronald P.; Robert; Ad; Guillermo; Sotiris; Cristiane Akemi; Gregor; Mojtaba; Marion; Kerrie; Evy; Ozgur; Tiziano; Susanna A.; Camila; David; Gustavo C.; Fusheng; Wanping; Cindy; Alicia; Renato Augusto; Andre Ricardo; George; Tamas; Erzsebet; Michel; Susanne; Antonia; Christos; Rob; Matthieu; Maria; Bernard; Kristiina S.; Ryan; Abeer; Eugenia; Levente; Zsolt; Nada; Alan; Harald; Kurt; Ellen L.; Alla; Anthony; Erika; Anna; Antonio F.; Andrew; Miia R.; Iran; Petter; Vera; Natalia; Marton; Akos P.; Giuseppina; Chew Yee; Margarita; Erzsebet; Jean Paul; Karin M.; Hee-Soo; Giancarlo; Francois; Peter J.; Arthur F. J.; Ana; Stefan; Eric; Diego Mauricio; Vincent; Julian; Roberto; Asaf; Nadhira S.; Rob A.; Erzsebet; Manuel; Tabea; Kristina; Ekaterina; Gavin; Vicky; Fabiom.; Hui; Antonia; Richard B.; Adrian; Shiela E.; Nathalie; Diana; Juliana Velasco; Tammi C.; Jaap; Jae-Hyuk; Miaomiao; Mikael R.; David B.; Scott E.; Isabelle; Axel A.; Gerhard H.; Reinhard; Jens C.; Gustavo H.; Jos; Berl; Istvan; Claudio; Bernhard; Patricia A.; Jennifer; Paul S.; Igor V. Universidade Estadual de Campinas (Unicamp)

WOS

Biomed Central Ltd; London 2017

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Expanding genomics of mycorrhizal symbiosis

Kuo, Alan ; Kohler, Annegret ; Martin, Francis M ; Grigoriev, Igor V Lawrence Berkeley National Lab. (Lbnl), Berkeley, Ca (United States) (Corporate Author)

Frontiers in Microbiology, 04 November 2014, Vol.5 [Periódico revisado por pares]

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Insights into bilaterian evolution from three spiralian genomes

Oleg Simakov ; Ferdinand Marletaz ; Sung-Jin Cho ; Eric Edsinger-Gonzales ; Paul Havlak ; Uffe Hellsten ; Dian-Han Kuo ; Tomas Larsson ; Jie Lv ; Detlev Arendt ; Robert Savage ; Kazutoyo Osoegawa ; Pieter De Jong ; Jane Grimwood ; Jarrod A. Chapman ; Harris Shapiro ; Andrea Aerts ; Robert P. Otillar ; Astrid Y. Terry ; Jeffrey L. Boore ; Igor V. Grigoriev ; David R. Lindberg ; Elaine C. Seaver ; David A. Weisblat ; Nicholas H. Putnam ; Daniel S. Rokhsar

Nature, 2012, Vol.493(7433), p.526 [Periódico revisado por pares]

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Pan genome of the phytoplankton Emiliania underpins its global distribution

Read, Betsy A ; Kegel, Jessica ; Klute, Mary J ; Kuo, Alan ; Lefebvre, Stephane C ; Maumus, Florian ; Mayer, Christoph ; Miller, John ; Monier, Adam ; Salamov, Asaf ; Young, Jeremy ; Aguilar, Maria ; Claverie, Jean - Michel ; Frickenhaus, Stephan ; Gonzalez, Karina ; Herman, Emily K ; Lin, Yao - Cheng ; Napier, Johnathan ; Ogata, Hiroyuki ; Sarno, Analissa F ; Shmutz, Jeremy ; Schroeder, Declan ; De Vargas, Colomban ; Verret, Frederic ; Von Dassow, Peter ; Valentin, Klaus ; Van De Peer, Yves ; Wheeler, Glen ; Dacks, Joel B ; Delwiche, Charles F ; Dyhrman, Sonya T ; Glöckner, Gernot ; John, Uwe ; Richards, Thomas ; Worden, Alexandra Z ; Zhang, Xiaoyu ; Grigoriev, Igor V

NATURE, 2013 [Periódico revisado por pares]

2013

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The GC-rich mitochondrial and plastid genomes of the green alga Coccomyxa give insight into the evolution of organelle DNA nucleotide landscape

Smith, David Roy ; Burki, Fabien ; Yamada, Takashi ; Grimwood, Jane ; Grigoriev, Igor V ; Van Etten, James L ; Keeling, Patrick J ; Kroymann, Juergen Lawrence Berkeley National Lab. (Lbnl), Berkeley, Ca (United States) (Corporate Author)

PLoS ONE, 26 August 2011, Vol.6(8) [Periódico revisado por pares]

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Widespread Polycistronic Transcripts in Fungi Revealed by Single-Molecule mRNA Sequencing

Gordon, Sean P ; Tseng, Elizabeth ; Salamov, Asaf ; Zhang, Jiwei ; Meng, Xiandong ; Zhao, Zhiying ; Kang, Dongwan ; Underwood, Jason ; Grigoriev, Igor V ; Figueroa, Melania ; Schilling, Jonathan S ; Chen, Feng ; Wang, Zhong

PloS one, 2015, Vol.10(7), pp.e0132628 [Periódico revisado por pares]

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Comparative Analysis of Secretome Profiles of Manganese(II)-Oxidizing Ascomycete Fungi

Zeiner, Carolyn A. ; Purvine, Samuel O. ; Zink, Erika M. ; Paša-Tolić, Ljiljana ; Chaput, Dominique L. ; Haridas, Sajeet ; Wu, Si ; Labutti, Kurt ; Grigoriev, Igor V. ; Henrissat, Bernard ; Santelli, Cara M. ; Hansel, Colleen M.

Zeiner, C. A., S. O. Purvine, E. M. Zink, L. Paša-Tolić, D. L. Chaput, S. Haridas, S. Wu, et al. 2016. “Comparative Analysis of Secretome Profiles of Manganese(II)-Oxidizing Ascomycete Fungi.” PLoS ONE 11 (7): e0157844. doi:10.1371/journal.pone.0157844. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0157844. [Periódico revisado por pares]

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Evolutionary genomics of the cold-adapted diatom Fragilariopsis cylindrus

Thomas Mock ; Robert P. Otillar ; Jan Strauss ; Mark Mcmullan ; Pirita Paajanen ; Jeremy Schmutz ; Asaf Salamov ; Remo Sanges ; Andrew Toseland ; Ben J. Ward ; Andrew E. Allen ; Christopher L. Dupont ; Stephan Frickenhaus ; Florian Maumus ; Alaguraj Veluchamy ; Taoyang Wu ; Kerrie W. Barry ; Angela Falciatore ; Maria I. Ferrante ; Antonio E. Fortunato ; Gernot Glöckner ; Ansgar Gruber ; Rachel Hipkin ; Michael G. Janech ; Peter G. Kroth ; Florian Leese ; Erika A. Lindquist ; Barbara R. Lyon ; Joel Martin ; Christoph Mayer ; Micaela Parker ; Hadi Quesneville ; James A. Raymond ; Christiane Uhlig ; Ruben E. Valas ; Klaus U. Valentin ; Alexandra Z. Worden ; E. Virginia Armbrust ; Matthew D. Clark ; Chris Bowler ; Beverley R. Green ; Vincent Moulton ; Cock Van Oosterhout ; Igor V. Grigoriev

Nature, 2017, p.1 [Periódico revisado por pares]

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Strand-Specific RNA-Seq Analyses of Fruiting Body Development in Coprinopsis cinerea

Muraguchi, Hajime ; Umezawa, Kiwamu ; Niikura, Mai ; Yoshida, Makoto ; Kozaki, Toshinori ; Ishii, Kazuo ; Sakai, Kiyota ; Shimizu, Motoyuki ; Nakahori, Kiyoshi ; Sakamoto, Yuichi ; Choi, Cindy ; Ngan, Chew Yee ; Lindquist, Eika ; Lipzen, Anna ; Tritt, Andrew ; Haridas, Sajeet ; Barry, Kerrie ; Grigoriev, Igor V ; Pukkila, Patricia J

PloS one, 2015, Vol.10(10), pp.e0141586 [Periódico revisado por pares]

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