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Sequence-specific reconstruction from fragmentary databases using seed sequences: implementation and validation on SAGE, proteome and generic sequencing data

Sobreira, Tiago J. P.; Gruber, Arthur Universidade De São Paulo

BIOINFORMATICS, v.24, n.15, p.1676-1680, 2008

OXFORD UNIV PRESS 2008

Acesso online

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Artigo
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A fast and robust statistical test based on likelihood ratio with Bartlett correction to identify Granger causality between gene sets

Fujita, Andre; Kojima, Kaname; Patriota, Alexandre G.; Sato, Joao R.; Severino, Patricia; Miyano, Satoru Universidade De São Paulo

BIOINFORMATICS, v.26, n.18, p.2349-2351, 2010

OXFORD UNIV PRESS 2010

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PK/DB: database for pharmacokinetic properties and predictive in silico ADME models

Moda, Tiago L.; Torres, Leonardo G.; Carrara, Alexandre E.; Andricopulo, Adriano Defino Universidade De São Paulo

BIOINFORMATICS, v.24, n.19, p.2270-2271, 2008

OXFORD UNIV PRESS 2008

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A Simpler and More Accurate AUTO-HDS Framework for Clustering and Visualization of Biological Data

Campello, Ricardo J. G. B.; Moulavi, Davoud; Sander, Joerg Universidade De São Paulo

IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, LOS ALAMITOS, v. 9, n. 6, pp. 1850-1852, NOV-DEC, 2012

IEEE COMPUTER SOC; LOS ALAMITOS 2012

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Artigo
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Modeling associations between genetic markers using Bayesian networks

Villanueva, Edwin; Maciel, Carlos Dias Universidade De São Paulo

BIOINFORMATICS, v.26, n.18, p.i632-i637, 2010

OXFORD UNIV PRESS 2010

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AMIN domains have a predicted role in localization of diverse periplasmic protein complexes

Souza, Robson Francisco De; Anantharaman, Vivek; Souza, Sandro Jose De; Aravind, L.; Gueiros-Filho, Frederico J. Universidade De São Paulo

BIOINFORMATICS, v.24, n.21, p.2423-2426, 2008

OXFORD UNIV PRESS 2008

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Inferring Contagion in Regulatory Networks

Fujita, Andre; Sato, Joao Ricardo; Demasi, Marcos Angelo Almeida; Yamaguchi, Rui; Shimamura, Teppei; Ferreira, Carlos Eduardo; Sogayar, Mari Cleide; Miyano, Satoru Universidade De São Paulo

IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, v.8, n.2, p.570-576, 2011

IEEE COMPUTER SOC 2011

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Identification of protein coding regions using the modified Gabor-wavelet transform

Mena-Chalco, Jesus P.; Carrer, Helaine; Zana, Yossi; Cesar Jr., Roberto M. Universidade De São Paulo

IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, v.5, n.2, p.198-207, 2008

IEEE COMPUTER SOC 2008

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Computer-aided drug design and ADMET predictions for identification and evaluation of novel potential farnesyltransferase inhibitors in cancer therapy

Silva, Carlos Henrique Tomich De Paula Da; Silva, Vinicius Barreto Da; Resende, Jonathan; Rodrigues, Patricia Franco; Bononi, Fernanda Cristina; Benevenuto, Carolina Gomes; Taft, Carlton Anthony Universidade De São Paulo

JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, v.28, n.6, p.513-523, 2010

ELSEVIER SCIENCE INC 2010

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Quantum-chemical, NMR and X-ray diffraction studies on (+/-)-1-[3,4-(methylenedioxy)phenyl]-2-methylaminopropane

Zapata-Torres, Gerald; Cassels, Bruce K.; Parra-Mouchet, Julia; Mascarenhas, Yvonne P.; Ellena, Javier; Araujo, A. S. De Universidade De São Paulo

JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING, v.26, n.8, p.1296-1305, 2008

ELSEVIER SCIENCE INC 2008

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