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GenomicInteractions: An R/Bioconductor package for manipulating and investigating chromatin interaction data

Harmston, Nathan ; Ing-Simmons, Elizabeth ; Perry, Malcolm ; Barešić, Anja ; Lenhard, Boris

BMC genomics, 17 November 2015, Vol.16, pp.963 [Periódico revisado por pares]

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Topologically associating domains are ancient features that coincide with Metazoan clusters of extreme noncoding conservation

Nathan Harmston ; Elizabeth Ing-Simmons ; Ge Tan ; Malcolm Perry ; Matthias Merkenschlager ; Boris Lenhard

Nature Communications, 01 September 2017, Vol.8(1), pp.1-13 [Periódico revisado por pares]

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Spatial enhancer clustering and regulation of enhancer-proximal genes by cohesin

Ing-Simmons, Elizabeth ; Seitan, Vlad C ; Faure, Andre J ; Flicek, Paul ; Carroll, Thomas ; Dekker, Job ; Fisher, Amanda G ; Lenhard, Boris ; Merkenschlager, Matthias

Genome research, April 2015, Vol.25(4), pp.504-13 [Periódico revisado por pares]

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Effect of repeat human blood feeding on Wolbachia density and dengue virus infection in Aedes aegypti

Amuzu, Hilaria E ; Simmons, Cameron P ; Mcgraw, Elizabeth A

Parasites & vectors, 24 April 2015, Vol.8, pp.246 [Periódico revisado por pares]

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Cohesin-based chromatin interactions enable regulated gene expression within preexisting architectural compartments

Seitan, Vlad C ; Faure, Andre J ; Zhan, Ye ; Mccord, Rachel Patton ; Lajoie, Bryan R ; Ing-Simmons, Elizabeth ; Lenhard, Boris ; Giorgetti, Luca ; Heard, Edith ; Fisher, Amanda G ; Flicek, Paul ; Dekker, Job ; Merkenschlager, Matthias

Genome research, December 2013, Vol.23(12), pp.2066-77 [Periódico revisado por pares]

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Control of inducible gene expression links cohesin to hematopoietic progenitor self-renewal and differentiation

Cuartero, Sergi ; Weiss, Felix D ; Dharmalingam, Gopuraja ; Guo, Ya ; Ing-Simmons, Elizabeth ; Masella, Silvia ; Robles-Rebollo, Irene ; Xiao, Xiaolin ; Wang, Yi-Fang ; Barozzi, Iros ; Djeghloul, Dounia ; Amano, Mariane T ; Niskanen, Henri ; Petretto, Enrico ; Dowell, Robin D ; Tachibana, Kikuë ; Kaikkonen, Minna U ; Nasmyth, Kim A ; Lenhard

Nature immunology, September 2018, Vol.19(9), pp.932-941 [Periódico revisado por pares]

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Dwarf locus mutants lacking three pituitary cell types result from mutations in the POU-domain gene pit-1

Sen Li ; E. Bryan Crenshaw ; Elizabeth J. Rawson ; Donna M. Simmons ; Larry W. Swanson ; Michael G. Rosenfeld

Nature, 1990, Vol.347(6293), p.528 [Periódico revisado por pares]

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Failure of actinomycin D to inhibit appearance of clotting activity by vitamin K in vitro

Lowenthal, J. ; Simmons, Elizabeth

Experientia, 1967, Vol.23(6), pp.421-422 [Periódico revisado por pares]

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Feedforward regulation of Myc coordinates lineage-specific with housekeeping gene expression during B cell progenitor cell differentiation

Isabel Ferreirós-Vidal ; Thomas Carroll ; Tianyi Zhang ; Vincenzo Lagani ; Ricardo N Ramirez ; Elizabeth Ing-Simmons ; Alicia G Gómez-Valadés ; Lee Cooper ; Ziwei Liang ; Georgios Papoutsoglou ; Gopuraja Dharmalingam ; Ya Guo ; Sonia Tarazona ; Sunjay J Fernandes ; Peri Noori ; Gilad Silberberg ; Amanda G Fisher

PLoS Biology, 01 April 2019, Vol.17(4), p.e2006506 [Periódico revisado por pares]

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Climate warming reduces fish production and benthic habitat in Lake Tanganyika, one of the most biodiverse freshwater ecosystems

Cohen, Andrew S ; Gergurich, Elizabeth L ; Kraemer, Benjamin M ; Mcglue, Michael M ; Mcintyre, Peter B ; Russell, James M ; Simmons, Jack D ; Swarzenski, Peter W

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 23 August 2016, Vol.113(34), pp.9563-8 [Periódico revisado por pares]

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