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A novel method of using Deep Belief Networks and genetic perturbation data to search for yeast signaling pathways

Lu, Songjian ; Fan, Xiaonan ; Chen, Lujia ; Lu, Xinghua

PloS one, 2018, Vol.13(9), pp.e0203871 [Periódico revisado por pares]

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The 3D organization of the yeast genome correlates with co-expression and reflects functional relations between genes

Homouz, Dirar ; Kudlicki, Andrzej S

PloS one, 2013, Vol.8(1), pp.e54699 [Periódico revisado por pares]

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3
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Artigo
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Constitutive versus responsive gene expression strategies for growth in changing environments

Geisel, Nico

PloS one, 2011, Vol.6(11), pp.e27033 [Periódico revisado por pares]

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Artigo
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Coordination of gene expression and growth-rate in natural populations of budding yeast

Tamari, Zvi ; Rosin, Dalia ; Voichek, Yoav ; Barkai, Naama

PloS one, 2014, Vol.9(2), pp.e88801 [Periódico revisado por pares]

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Artigo
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RNA-Seq Reveals OTA-Related Gene Transcriptional Changes in Aspergillus carbonarius

Gerin, Donato ; De Miccolis Angelini, Rita M ; Pollastro, Stefania ; Faretra, Francesco

PloS one, 2016, Vol.11(1), pp.e0147089 [Periódico revisado por pares]

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Artigo
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Gene expression differences among three Neurospora species reveal genes required for sexual reproduction in Neurospora crassa

Lehr, Nina A ; Wang, Zheng ; Li, Ning ; Hewitt, David A ; López-Giráldez, Francesc ; Trail, Frances ; Townsend, Jeffrey P

PloS one, 2014, Vol.9(10), pp.e110398 [Periódico revisado por pares]

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Artigo
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Whole genome wide expression profiles on germination of Verticillium dahliae microsclerotia

Hu, Dongfang ; Wang, Chunsheng ; Tao, Fei ; Cui, Qian ; Xu, Xiangming ; Shang, Wenjing ; Hu, Xiaoping

PloS one, 2014, Vol.9(6), pp.e100046 [Periódico revisado por pares]

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Principal-oscillation-pattern analysis of gene expression

Wang, Daifeng ; Arapostathis, Ari ; Wilke, Claus O ; Markey, Mia K

PloS one, 2012, Vol.7(1), pp.e28805 [Periódico revisado por pares]

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Comparative transcriptomics of the saprobic and parasitic growth phases in Coccidioides spp

Whiston, Emily ; Zhang Wise, Hua ; Sharpton, Thomas J ; Jui, Ginger ; Cole, Garry T ; Taylor, John W

PloS one, 2012, Vol.7(7), pp.e41034 [Periódico revisado por pares]

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10
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Artigo
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Metabolomic and Transcriptomic Comparison of Solid-State and Submerged Fermentation of Penicillium expansum KACC 40815

Kim, Hyang Yeon ; Heo, Do Yeon ; Park, Hye Min ; Singh, Digar ; Lee, Choong Hwan

PloS one, 2016, Vol.11(2), pp.e0149012 [Periódico revisado por pares]

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