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e Thread: A Highly Optimized Machine Learning-Based Approach to Meta-Threading and the Modeling of Protein Tertiary Structures (Protein Structure Modeling Using Meta-Threading)

Brylinski, Michal ; Lingam, Daswanth Kurgan, Lukasz (Editor)

2012, Vol.7(11), p.e50200 [Periódico revisado por pares]

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Secondary Structure, a Missing Component of Sequence-Based Minimotif Definitions (Structure Is a Missing Component of Minimotifs)

Sargeant, David P ; Gryk, Michael R ; Maciejewski, Mark W ; Thapar, Vishal ; Kundeti, Vamsi ; Rajasekaran, Sanguthevar ; Romero, Pedro ; Dunker, Keith ; Li, Shun-Cheng ; Kaneko, Tomonori ; Schiller, Martin R Kurgan, Lukasz (Editor)

2012, Vol.7(12), p.e49957 [Periódico revisado por pares]

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Position-Specific Analysis and Prediction for Protein Lysine Acetylation Based on Multiple Features (Prediction for Lysine Acetylation)

Suo, Sheng-Bao ; Qiu, Jian-Ding ; Shi, Shao-Ping ; Sun, Xing-Yu ; Huang, Shu-Yun ; Chen, Xiang ; Liang, Ru-Ping Kurgan, Lukasz (Editor)

2012, Vol.7(11), p.e49108 [Periódico revisado por pares]

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BEST: Improved Prediction of B-Cell Epitopes from Antigen Sequences (BEST: Sequence-Based Prediction of B-Cell Epitopes)

Gao, Jianzhao ; Faraggi, Eshel ; Zhou, Yaoqi ; Ruan, Jishou ; Kurgan, Lukasz Uversky, Vladimir N. (Editor)

PLoS ONE, 2012, Vol.7(6), p.e40104 [Periódico revisado por pares]

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GPS-MBA: Computational Analysis of MHC Class II Epitopes in Type 1 Diabetes (Prediction of I-Ag7 and HLA-DQ8 Binding Peptides)

Cai, Ruikun ; Liu, Zexian ; Ren, Jian ; Ma, Chuang ; Gao, Tianshun ; Zhou, Yanhong ; Yang, Qing ; Xue, Yu Kurgan, Lukasz (Editor)

PLoS ONE, 2012, Vol.7(3), p.e33884 [Periódico revisado por pares]

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Prediction of Protein Cleavage Site with Feature Selection by Random Forest (Prediction of Protein Cleavage Site)

Li, Bi-Qing ; Cai, Yu-Dong ; Feng, Kai-Yan ; Zhao, Gui-Jun Kurgan, Lukasz (Editor)

2012, Vol.7(9), p.e45854 [Periódico revisado por pares]

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Towards the Improved Discovery and Design of Functional Peptides: Common Features of Diverse Classes Permit Generalized Prediction of Bioactivity (Discovery and Design of Functional Peptides)

Mooney, Catherine ; Haslam, Niall J ; Pollastri, Gianluca ; Shields, Denis C Kurgan, Lukasz (Editor)

2012, Vol.7(10), p.e45012 [Periódico revisado por pares]

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Semi-Supervised Prediction of SH2-Peptide Interactions from Imbalanced High-Throughput Data

Kundu, Kousik ; Costa, Fabrizio ; Huber, Michael ; Reth, Michael ; Backofen, Rolf Kurgan, Lukasz (editor)

PLoS ONE, 2013, Vol.8(5) [Periódico revisado por pares]

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FFPred 2.0: Improved Homology-Independent Prediction of Gene Ontology Terms for Eukaryotic Protein Sequences

Minneci, Federico ; Piovesan, Damiano ; Cozzetto, Domenico ; Jones, David T Kurgan, Lukasz (editor)

PLoS ONE, 2013, Vol.8(5) [Periódico revisado por pares]

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Prediction and Analysis of Post-Translational Pyruvoyl Residue Modification Sites from Internal Serines in Proteins

Jiang, Yang ; Li, Bi-Qing ; Zhang, Yuchao ; Feng, Yuan-Ming ; Gao, Yu-Fei ; Zhang, Ning ; Cai, Yu-Dong Kurgan, Lukasz (editor)

PLoS ONE, 2013, Vol.8(6) [Periódico revisado por pares]

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