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STEM: a tool for the analysis of short time series gene expression data
STEM: a tool for the analysis of short time series gene expression data
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STEM: a tool for the analysis of short time series gene expression data

Ernst, Jason ; Bar-Joseph, Ziv

BMC bioinformatics, 2006-04, Vol.7 (1), p.191-191, Article 191 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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2
Universal annotation of the human genome through integration of over a thousand epigenomic datasets
Universal annotation of the human genome through integration of over a thousand epigenomic datasets
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Universal annotation of the human genome through integration of over a thousand epigenomic datasets

Vu, Ha ; Ernst, Jason

Genome Biology, 2022-01, Vol.23 (1), p.9-9, Article 9 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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3
ChromGene: gene-based modeling of epigenomic data
ChromGene: gene-based modeling of epigenomic data
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ChromGene: gene-based modeling of epigenomic data

Jaroszewicz, Artur ; Ernst, Jason

Genome Biology, 2023-09, Vol.24 (1), p.1-203, Article 203 [Periódico revisado por pares]

London: BioMed Central Ltd

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4
Interplay between chromatin state, regulator binding, and regulatory motifs in six human cell types
Interplay between chromatin state, regulator binding, and regulatory motifs in six human cell types
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Interplay between chromatin state, regulator binding, and regulatory motifs in six human cell types

Ernst, Jason ; Kellis, Manolis

Genome research, 2013-07, Vol.23 (7), p.1142-1154 [Periódico revisado por pares]

United States: Cold Spring Harbor Laboratory Press

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5
Universal chromatin state annotation of the mouse genome
Universal chromatin state annotation of the mouse genome
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Universal chromatin state annotation of the mouse genome

Vu, Ha ; Ernst, Jason

Genome Biology, 2023-06, Vol.24 (1), p.153-153, Article 153 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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6
Learning a genome-wide score of human-mouse conservation at the functional genomics level
Learning a genome-wide score of human-mouse conservation at the functional genomics level
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Learning a genome-wide score of human-mouse conservation at the functional genomics level

Kwon, Soo Bin ; Ernst, Jason

Nature communications, 2021-05, Vol.12 (1), p.2495-2495, Article 2495 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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7
Clustering short time series gene expression data
Clustering short time series gene expression data
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Clustering short time series gene expression data

Ernst, Jason ; Nau, Gerard J. ; Bar-Joseph, Ziv

Bioinformatics, 2005-06, Vol.21 (suppl-1), p.i159-i168 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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8
Systematic dissection of regulatory motifs in 2000 predicted human enhancers using a massively parallel reporter assay
Systematic dissection of regulatory motifs in 2000 predicted human enhancers using a massively parallel reporter assay
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Systematic dissection of regulatory motifs in 2000 predicted human enhancers using a massively parallel reporter assay

Kheradpour, Pouya ; Ernst, Jason ; Melnikov, Alexandre ; Rogov, Peter ; Wang, Li ; Zhang, Xiaolan ; Alston, Jessica ; Mikkelsen, Tarjei S ; Kellis, Manolis

Genome research, 2013-05, Vol.23 (5), p.800-811 [Periódico revisado por pares]

United States: Cold Spring Harbor Laboratory Press

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9
ChromTime: modeling spatio-temporal dynamics of chromatin marks
ChromTime: modeling spatio-temporal dynamics of chromatin marks
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ChromTime: modeling spatio-temporal dynamics of chromatin marks

Fiziev, Petko ; Ernst, Jason

Genome Biology, 2018-08, Vol.19 (1), p.109-109, Article 109 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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10
Investigating enhancer evolution with massively parallel reporter assays
Investigating enhancer evolution with massively parallel reporter assays
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Investigating enhancer evolution with massively parallel reporter assays

Kwon, Soo Bin ; Ernst, Jason

Genome Biology, 2018-08, Vol.19 (1), p.114-114, Article 114 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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