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1
Material Type:
Tese de Doutorado
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BioAutoML: Democratizing Machine Learning in Life Sciences

Bonidia, Robson Parmezan

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação 2024-01-31

Acesso online

2
Material Type:
Artigo
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BioDeepfuse a hybrid deep learning approach with integrated feature extraction techniques for enhanced non-coding RNA classification

Anderson Paulo Avila Santos Breno Lívio Silva de Almeida; Robson Parmezan Bonidia; Peter F Stadler; Polonca Štefanič; Ines Mandic-Mulec; Ulisses Nunes da Rocha; Danilo Sipoli Sanches; Andre Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho

RNA Biology Philadelphia v. 21, n. 1, p. 1-12, 2024

Philadelphia 2024

Localização: ICMC - Inst. Ciên. Mat. Computação    (PROD-3189058 )(Acessar)

3
Material Type:
Artigo de Congresso
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BioPrediction democratizing machine learning in the study of molecular interactions

Bruno Rafael Florentino Natan Henrique Sanches; Robson Parmezan Bonidia; André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho; Encontro Nacional de Inteligência Artificial e Computacional - ENIAC (20. 2023 Belo Horizonte)

Anais Porto Alegre: SBC, 2023

Porto Alegre SBC 2023

Localização: ICMC - Inst. Ciên. Mat. Computação    (PROD-3160886 ) e outros locais(Acessar)

4
Material Type:
Artigo de Congresso
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BioPrediction democratizando a aprendizagem de máquina no estudo de interações moleculares

Bruno Rafael Florentino Robson Parmezan Bonidia; Natan Henrique Sanches; André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho; Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da Universidade de São Paulo - SIICUSP (31. 2023 São Carlos)

Resumos São Paulo: Universidade de São Paulo - USP, 2023

São Paulo Universidade de São Paulo - USP 2023

Localização: IFSC - Inst. Física de São Carlos    (PROD035292 )(Acessar)

5
Material Type:
Artigo
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The AnimalAssociatedMetagenomeDB reveals a bias towards livestock and developed countries and blind spots in functional-potential studies of animal-associated microbiomes

Anderson Paulo Avila Santos Muhammad Kabiru Nata'ala; Jonas Coelho Kasmanas; Alexander Bartholomäus; Tina Keller-Costa; Stephanie D Jurburg; Tamara Tal; Amélia Camarinha-Silva; João Pedro Saraiva; André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho; Peter F Stadler; Danilo Sipoli Sanches; Ulisses Nunes da Rocha

Animal Microbiome London v. 5, p. 1-13, 2023

London 2023

Localização: ICMC - Inst. Ciên. Mat. Computação    (PROD-3160952 )(Acessar)

6
Material Type:
Dissertação de Mestrado
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Pipeline OligoY para desenho de sondas oligopaint do cromossomo Y incluindo sequências repetitivas

Almeida, Isabela Pimentel De

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Bioinformática 2022-01-26

Acesso online. A biblioteca também possui exemplares impressos.

7
Material Type:
Artigo
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MathFeature feature extraction package for DNA, RNA and protein sequences based on mathematical

Robson Parmezan Bonidia Douglas S Domingues; Danilo Sipoli Sanches; André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho

Briefings in Bioinformatics Oxford v. 23, n. 1, p. 1-10, 2022

Oxford 2022

Localização: ICMC - Inst. Ciên. Mat. Computação    (PROD-3049966 )(Acessar)

8
Material Type:
Livro
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Computação ciência, engenharia e arte

Claudia Maria Bauzer Medeiros André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho; Helder Takashi Imoto Nakaya; João Marcos Travassos Romano; Marcelo Knörich Zuffo 1966-; Virgilio Augusto Fernandes Almeida

Andricopulo, Adriano Defini, ed FAPESP 60 anos : a ciência no desenvolvimento nacional São Carlos : Cubo, 2022 221 p

São Carlos Cubo 2022

Localização: ICMC - Inst. Ciên. Mat. Computação    (PROD-3129583 )(Acessar)

9
Material Type:
Artigo
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Information theory for biological sequence classification a novel feature extraction technique based on Tsallis entropy

Robson Parmezan Bonidia Anderson Paulo Avila Santos; Breno Lívio Silva de Almeida; Peter F Stadler; Ulisses Nunes da Rocha; Danilo Sipoli Sanches; André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho

Entropy Basel v. 24, n. 10, p. 1-17, 2022

Basel 2022

Localização: ICMC - Inst. Ciên. Mat. Computação    (PROD-3105627 )(Acessar)

10
Material Type:
Artigo
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BioAutoML automated feature engineering and metalearning to predict noncoding RNAs in bacteria

Robson Parmezan Bonidia Anderson Paulo Avila Santos; Breno Lívio Silva de Almeida; Peter F Stadler; Ulisses Nunes da Rocha; Danilo Sipoli Sanches; André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho

Briefings in Bioinformatics Oxford v. 23, n. 4, p. 1-13, 2022

Oxford 2022

Localização: ICMC - Inst. Ciên. Mat. Computação    (PROD-3084111 )(Acessar)

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