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PEDL+: protein-centered relation extraction from PubMed at your fingertip
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PEDL+: protein-centered relation extraction from PubMed at your fingertip

Weber, Leon ; Barth, Fabio ; Lorenz, Leonie ; Konrath, Fabian ; Huska, Kirsten ; Wolf, Jana ; Leser, Ulf Lu, Zhiyong

Bioinformatics (Oxford, England), 2023-11, Vol.39 (11) [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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2
EVpedia: a community web portal for extracellular vesicles research
EVpedia: a community web portal for extracellular vesicles research
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EVpedia: a community web portal for extracellular vesicles research

Kim, Dae-Kyum ; Lee, Jaewook ; Kim, Sae Rom ; Choi, Dong-Sic ; Yoon, Yae Jin ; Kim, Ji Hyun ; Go, Gyeongyun ; Nhung, Dinh ; Hong, Kahye ; Jang, Su Chul ; Kim, Si-Hyun ; Park, Kyong-Su ; Kim, Oh Youn ; Park, Hyun Taek ; Seo, Ji Hye ; Aikawa, Elena ; Baj-Krzyworzeka, Monika ; van Balkom, Bas W M ; Belting, Mattias ; Blanc, Lionel ; Bond, Vincent ; Bongiovanni, Antonella ; Borràs, Francesc E ; Buée, Luc ; Buzás, Edit I ; Cheng, Lesley ; Clayton, Aled ; Cocucci, Emanuele ; Dela Cruz, Charles S ; Desiderio, Dominic M ; Di Vizio, Dolores ; Ekström, Karin ; Falcon-Perez, Juan M ; Gardiner, Chris ; Giebel, Bernd ; Greening, David W ; Gross, Julia Christina ; Gupta, Dwijendra ; Hendrix, An ; Hill, Andrew F ; Hill, Michelle M ; Nolte-'t Hoen, Esther ; Hwang, Do Won ; Inal, Jameel ; Jagannadham, Medicharla V ; Jayachandran, Muthuvel ; Jee, Young-Koo ; Jørgensen, Malene ; Kim, Kwang Pyo ; Kim, Yoon-Keun ; Kislinger, Thomas ; Lässer, Cecilia ; Lee, Dong Soo ; Lee, Hakmo ; van Leeuwen, Johannes ; Lener, Thomas ; Liu, Ming-Lin ; Lötvall, Jan ; Marcilla, Antonio ; Mathivanan, Suresh ; Möller, Andreas ; Morhayim, Jess ; Mullier, François ; Nazarenko, Irina ; Nieuwland, Rienk ; Nunes, Diana N ; Pang, Ken ; Park, Jaesung ; Patel, Tushar ; Pocsfalvi, Gabriella ; Del Portillo, Hernando ; Putz, Ulrich ; Ramirez, Marcel I ; Rodrigues, Marcio L ; Roh, Tae-Young ; Royo, Felix ; Sahoo, Susmita ; Schiffelers, Raymond ; Sharma, Shivani ; Siljander, Pia ; Simpson, Richard J ; Soekmadji, Carolina ; Stahl, Philip ; Stensballe, Allan ; Stępień, Ewa ; Tahara, Hidetoshi ; Trummer, Arne ; Valadi, Hadi ; Vella, Laura J ; Wai, Sun Nyunt ; Witwer, Kenneth ; Yáñez-Mó, María ; Youn, Hyewon ; Zeidler, Reinhard ; Gho, Yong Song

Bioinformatics, 2015-03, Vol.31 (6), p.933-939 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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3
ShinyGO: a graphical gene-set enrichment tool for animals and plants
ShinyGO: a graphical gene-set enrichment tool for animals and plants
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ShinyGO: a graphical gene-set enrichment tool for animals and plants

Ge, Steven Xijin ; Jung, Dongmin ; Yao, Runan Valencia, Alfonso

Bioinformatics, 2020-04, Vol.36 (8), p.2628-2629 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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pKPDB: a protein data bank extension database of pKa and pI theoretical values
pKPDB: a protein data bank extension database of pKa and pI theoretical values
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pKPDB: a protein data bank extension database of pKa and pI theoretical values

Reis, Pedro B P S ; Clevert, Djork-Arné ; Machuqueiro, Miguel

Bioinformatics, 2021-12, Vol.38 (1), p.297-298 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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5
NMRFAM-SPARKY: enhanced software for biomolecular NMR spectroscopy
NMRFAM-SPARKY: enhanced software for biomolecular NMR spectroscopy
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NMRFAM-SPARKY: enhanced software for biomolecular NMR spectroscopy

Lee, Woonghee ; Tonelli, Marco ; Markley, John L

Bioinformatics, 2015-04, Vol.31 (8), p.1325-1327 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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6
Gemma: a resource for the reuse, sharing and meta-analysis of expression profiling data
Gemma: a resource for the reuse, sharing and meta-analysis of expression profiling data
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Gemma: a resource for the reuse, sharing and meta-analysis of expression profiling data

ZOUBAREV, Anton ; HAMER, Kelsey M ; GILLIS, Jesse ; PAVLIDIS, Paul ; KESHAV, Kiran D ; LUKE MCCARTHY, E ; SANTOS, Joseph Roy C ; VAN ROSSUM, Thea ; MCDONALD, Cameron ; HALL, Adam ; XIANG WAN ; LIM, Raymond

Bioinformatics, 2012-09, Vol.28 (17), p.2272-2273 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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7
Tax4Fun: predicting functional profiles from metagenomic 16S rRNA data
Tax4Fun: predicting functional profiles from metagenomic 16S rRNA data
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Tax4Fun: predicting functional profiles from metagenomic 16S rRNA data

Aßhauer, Kathrin P ; Wemheuer, Bernd ; Daniel, Rolf ; Meinicke, Peter

Bioinformatics, 2015-09, Vol.31 (17), p.2882-2884 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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8
UniRef clusters: a comprehensive and scalable alternative for improving sequence similarity searches
UniRef clusters: a comprehensive and scalable alternative for improving sequence similarity searches
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UniRef clusters: a comprehensive and scalable alternative for improving sequence similarity searches

Suzek, Baris E ; Wang, Yuqi ; Huang, Hongzhan ; McGarvey, Peter B ; Wu, Cathy H

Bioinformatics, 2015-03, Vol.31 (6), p.926-932 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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PANNZER: high-throughput functional annotation of uncharacterized proteins in an error-prone environment
PANNZER: high-throughput functional annotation of uncharacterized proteins in an error-prone environment
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PANNZER: high-throughput functional annotation of uncharacterized proteins in an error-prone environment

Koskinen, Patrik ; Törönen, Petri ; Nokso-Koivisto, Jussi ; Holm, Liisa

Bioinformatics, 2015-05, Vol.31 (10), p.1544-1552 [Periódico revisado por pares]

England

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10
PDID: database of molecular-level putative protein-drug interactions in the structural human proteome
PDID: database of molecular-level putative protein-drug interactions in the structural human proteome
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PDID: database of molecular-level putative protein-drug interactions in the structural human proteome

Wang, Chen ; Hu, Gang ; Wang, Kui ; Brylinski, Michal ; Xie, Lei ; Kurgan, Lukasz

Bioinformatics, 2016-02, Vol.32 (4), p.579-586 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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