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Avoiding Pandemic Fears in the Subway and Conquering the Platypus
Avoiding Pandemic Fears in the Subway and Conquering the Platypus
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Avoiding Pandemic Fears in the Subway and Conquering the Platypus

Gonzalez, A ; Vázquez-Baeza, Y ; Pettengill, J B ; Ottesen, A ; McDonald, D ; Knight, R

mSystems, 2016-05, Vol.1 (3) [Periódico revisado por pares]

United States: American Society for Microbiology

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Meta-analyses of studies of the human microbiota
Meta-analyses of studies of the human microbiota
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Meta-analyses of studies of the human microbiota

Lozupone, Catherine A ; Stombaugh, Jesse ; Gonzalez, Antonio ; Ackermann, Gail ; Wendel, Doug ; Vázquez-Baeza, Yoshiki ; Jansson, Janet K ; Gordon, Jeffrey I ; Knight, Rob

Genome research, 2013-10, Vol.23 (10), p.1704-1714 [Periódico revisado por pares]

United States: Cold Spring Harbor Laboratory Press

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3
Longitudinal analysis of microbial interaction between humans and the indoor environment
Longitudinal analysis of microbial interaction between humans and the indoor environment
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Longitudinal analysis of microbial interaction between humans and the indoor environment

Lax, Simon ; Smith, Daniel P. ; Hampton-Marcell, Jarrad ; Owens, Sarah M. ; Handley, Kim M. ; Scott, Nicole M. ; Gibbons, Sean M. ; Larsen, Peter ; Shogan, Benjamin D. ; Weiss, Sophie ; Metcalf, Jessica L. ; Ursell, Luke K. ; Vázquez-Baeza, Yoshiki ; Van Treuren, Will ; Hasan, Nur A. ; Gibson, Molly K. ; Colwell, Rita ; Dantas, Gautam ; Knight, Rob ; Gilbert, Jack A.

Science (American Association for the Advancement of Science), 2014-08, Vol.345 (6200), p.1048-1052 [Periódico revisado por pares]

United States: American Association for the Advancement of Science

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4
OP31 Meta–omics reveals microbiome-driven proteolysis as a contributing factor to the severity of ulcerative colitis disease activity
OP31 Meta–omics reveals microbiome-driven proteolysis as a contributing factor to the severity of ulcerative colitis disease activity
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OP31 Meta–omics reveals microbiome-driven proteolysis as a contributing factor to the severity of ulcerative colitis disease activity

Mills, R ; Dulai, P ; Vázquez-Baeza, Y ; Zhu, Q ; Humphrey, G ; DeRight Goldasich, L ; Quinn, R ; Gewirtz, A ; Chassaing, B ; Chu, H ; Sandborn, W ; Dorrestein, P ; Knight, R ; Gonzalez, D

Journal of Crohn's and colitis, 2020-01, Vol.14 (Supplement_1), p.S030-S031 [Periódico revisado por pares]

US: Oxford University Press

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5
Multi-omics of the gut microbial ecosystem in inflammatory bowel diseases
Multi-omics of the gut microbial ecosystem in inflammatory bowel diseases
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Multi-omics of the gut microbial ecosystem in inflammatory bowel diseases

Lloyd-Price, Jason ; Arze, Cesar ; Ananthakrishnan, Ashwin N ; Schirmer, Melanie ; Avila-Pacheco, Julian ; Poon, Tiffany W ; Andrews, Elizabeth ; Ajami, Nadim J ; Bonham, Kevin S ; Brislawn, Colin J ; Casero, David ; Courtney, Holly ; Gonzalez, Antonio ; Graeber, Thomas G ; Hall, A Brantley ; Lake, Kathleen ; Landers, Carol J ; Mallick, Himel ; Plichta, Damian R ; Prasad, Mahadev ; Rahnavard, Gholamali ; Sauk, Jenny ; Shungin, Dmitry ; Vázquez-Baeza, Yoshiki ; White, 3rd, Richard A ; Braun, Jonathan ; Denson, Lee A ; Jansson, Janet K ; Knight, Rob ; Kugathasan, Subra ; McGovern, Dermot P B ; Petrosino, Joseph F ; Stappenbeck, Thaddeus S ; Winter, Harland S ; Clish, Clary B ; Franzosa, Eric A ; Vlamakis, Hera ; Xavier, Ramnik J ; Huttenhower, Curtis

Nature (London), 2019-05, Vol.569 (7758), p.655-662 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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6
Normalization and microbial differential abundance strategies depend upon data characteristics
Normalization and microbial differential abundance strategies depend upon data characteristics
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Normalization and microbial differential abundance strategies depend upon data characteristics

Weiss, Sophie ; Xu, Zhenjiang Zech ; Peddada, Shyamal ; Amir, Amnon ; Bittinger, Kyle ; Gonzalez, Antonio ; Lozupone, Catherine ; Zaneveld, Jesse R ; Vázquez-Baeza, Yoshiki ; Birmingham, Amanda ; Hyde, Embriette R ; Knight, Rob

Microbiome, 2017-03, Vol.5 (1), p.27-27, Article 27 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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7
Microbiome 101: Studying, Analyzing, and Interpreting Gut Microbiome Data for Clinicians
Microbiome 101: Studying, Analyzing, and Interpreting Gut Microbiome Data for Clinicians
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Microbiome 101: Studying, Analyzing, and Interpreting Gut Microbiome Data for Clinicians

Allaband, Celeste ; McDonald, Daniel ; Vázquez-Baeza, Yoshiki ; Minich, Jeremiah J. ; Tripathi, Anupriya ; Brenner, David A. ; Loomba, Rohit ; Smarr, Larry ; Sandborn, William J. ; Schnabl, Bernd ; Dorrestein, Pieter ; Zarrinpar, Amir ; Knight, Rob

Clinical gastroenterology and hepatology, 2019-01, Vol.17 (2), p.218-230 [Periódico revisado por pares]

United States: Elsevier Inc

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8
The Treatment-Naive Microbiome in New-Onset Crohn’s Disease
The Treatment-Naive Microbiome in New-Onset Crohn’s Disease
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The Treatment-Naive Microbiome in New-Onset Crohn’s Disease

Gevers, Dirk ; Kugathasan, Subra ; Denson, Lee A. ; Vázquez-Baeza, Yoshiki ; Van Treuren, Will ; Ren, Boyu ; Schwager, Emma ; Knights, Dan ; Song, Se Jin ; Yassour, Moran ; Morgan, Xochitl C. ; Kostic, Aleksandar D. ; Luo, Chengwei ; González, Antonio ; McDonald, Daniel ; Haberman, Yael ; Walters, Thomas ; Baker, Susan ; Rosh, Joel ; Stephens, Michael ; Heyman, Melvin ; Markowitz, James ; Baldassano, Robert ; Griffiths, Anne ; Sylvester, Francisco ; Mack, David ; Kim, Sandra ; Crandall, Wallace ; Hyams, Jeffrey ; Huttenhower, Curtis ; Knight, Rob ; Xavier, Ramnik J.

Cell host & microbe, 2014-03, Vol.15 (3), p.382-392 [Periódico revisado por pares]

United States: Elsevier Inc

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9
Microbial Diversity in Clinical Microbiome Studies: Sample Size and Statistical Power Considerations
Microbial Diversity in Clinical Microbiome Studies: Sample Size and Statistical Power Considerations
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Microbial Diversity in Clinical Microbiome Studies: Sample Size and Statistical Power Considerations

Casals-Pascual, Climent ; González, Antonio ; Vázquez-Baeza, Yoshiki ; Song, Se Jin ; Jiang, Lingjing ; Knight, Rob

Gastroenterology (New York, N.Y. 1943), 2020-05, Vol.158 (6), p.1524-1528 [Periódico revisado por pares]

United States: Elsevier Inc

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10
Challenges in benchmarking metagenomic profilers
Challenges in benchmarking metagenomic profilers
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Challenges in benchmarking metagenomic profilers

Sun, Zheng ; Huang, Shi ; Zhang, Meng ; Zhu, Qiyun ; Haiminen, Niina ; Carrieri, Anna Paola ; Vázquez-Baeza, Yoshiki ; Parida, Laxmi ; Kim, Ho-Cheol ; Knight, Rob ; Liu, Yang-Yu

Nature methods, 2021-06, Vol.18 (6), p.618-626 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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