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Martini 3: a general purpose force field for coarse-grained molecular dynamics
Martini 3: a general purpose force field for coarse-grained molecular dynamics
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Martini 3: a general purpose force field for coarse-grained molecular dynamics

Souza, Paulo C T ; Alessandri, Riccardo ; Barnoud, Jonathan ; Thallmair, Sebastian ; Faustino, Ignacio ; Grünewald, Fabian ; Patmanidis, Ilias ; Abdizadeh, Haleh ; Bruininks, Bart M H ; Wassenaar, Tsjerk A ; Kroon, Peter C ; Melcr, Josef ; Nieto, Vincent ; Corradi, Valentina ; Khan, Hanif M ; Domański, Jan ; Javanainen, Matti ; Martinez-Seara, Hector ; Reuter, Nathalie ; Best, Robert B ; Vattulainen, Ilpo ; Monticelli, Luca ; Periole, Xavier ; Tieleman, D Peter ; de Vries, Alex H ; Marrink, Siewert J

Nature methods, 2021-04, Vol.18 (4), p.382-388 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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2
A comparison of TEM and DLS methods to characterize size distribution of ceramic nanoparticles
A comparison of TEM and DLS methods to characterize size distribution of ceramic nanoparticles
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A comparison of TEM and DLS methods to characterize size distribution of ceramic nanoparticles

Souza, T. G. F. ; Ciminelli, V. S. T. ; Mohallem, N. D. S.

Journal of physics. Conference series, 2016-07, Vol.733 (1), p.12039 [Periódico revisado por pares]

Bristol: IOP Publishing

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3
Protein–ligand binding with the coarse-grained Martini model
Protein–ligand binding with the coarse-grained Martini model
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Protein–ligand binding with the coarse-grained Martini model

Souza, Paulo C. T. ; Thallmair, Sebastian ; Conflitti, Paolo ; Ramírez-Palacios, Carlos ; Alessandri, Riccardo ; Raniolo, Stefano ; Limongelli, Vittorio ; Marrink, Siewert J.

Nature communications, 2020-07, Vol.11 (1), p.1-11, Article 3714 [Periódico revisado por pares]

London: Nature Publishing Group

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4
Ferromagnetic Ground States in Face-Centered Cubic Hubbard Clusters
Ferromagnetic Ground States in Face-Centered Cubic Hubbard Clusters
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Ferromagnetic Ground States in Face-Centered Cubic Hubbard Clusters

Souza, T X R ; Macedo, C A Rozhkova, Elena A.

PloS one, 2016-09, Vol.11 (9), p.e0161549-e0161549 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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5
Unusual Angular Dependence of the Raman Response in Black Phosphorus
Unusual Angular Dependence of the Raman Response in Black Phosphorus
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Unusual Angular Dependence of the Raman Response in Black Phosphorus

Ribeiro, Henrique B ; Pimenta, Marcos A ; de Matos, Christiano J. S ; Moreira, Roberto Luiz ; Rodin, Aleksandr S ; Zapata, Juan D ; de Souza, Eunézio A. T ; Castro Neto, Antonio H

ACS nano, 2015-04, Vol.9 (4), p.4270-4276 [Periódico revisado por pares]

United States: American Chemical Society

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6
Polyply; a python suite for facilitating simulations of macromolecules and nanomaterials
Polyply; a python suite for facilitating simulations of macromolecules and nanomaterials
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Polyply; a python suite for facilitating simulations of macromolecules and nanomaterials

Grünewald, Fabian ; Alessandri, Riccardo ; Kroon, Peter C ; Monticelli, Luca ; Souza, Paulo C T ; Marrink, Siewert J

Nature communications, 2022-01, Vol.13 (1), p.68-12, Article 68 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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7
Fish and mussels: Importance of fish for freshwater mussel conservation
Fish and mussels: Importance of fish for freshwater mussel conservation
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Fish and mussels: Importance of fish for freshwater mussel conservation

Modesto, Vanessa ; Ilarri, Martina ; Souza, Allan T ; Lopes‐Lima, Manuel ; Douda, Karel ; Clavero, Miguel ; Sousa, Ronaldo

Fish and fisheries (Oxford, England), 2018-03, Vol.19 (2), p.244-259 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Blackwell Publishing Ltd

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8
Biosilicate® — A multipurpose, highly bioactive glass-ceramic. In vitro, in vivo and clinical trials
Biosilicate® — A multipurpose, highly bioactive glass-ceramic. In vitro, in vivo and clinical trials
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Biosilicate® — A multipurpose, highly bioactive glass-ceramic. In vitro, in vivo and clinical trials

Crovace, Murilo C. ; Souza, Marina T. ; Chinaglia, Clever R. ; Peitl, Oscar ; Zanotto, Edgar D.

Journal of non-crystalline solids, 2016-01, Vol.432, p.90-110 [Periódico revisado por pares]

Elsevier B.V

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9
Expanding conservation culturomics and iEcology from terrestrial to aquatic realms
Expanding conservation culturomics and iEcology from terrestrial to aquatic realms
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Expanding conservation culturomics and iEcology from terrestrial to aquatic realms

Jarić, Ivan ; Roll, Uri ; Arlinghaus, Robert ; Belmaker, Jonathan ; Chen, Yan ; China, Victor ; Douda, Karel ; Essl, Franz ; Jähnig, Sonja C ; Jeschke, Jonathan M ; Kalinkat, Gregor ; Kalous, Lukáš ; Ladle, Richard ; Lennox, Robert J ; Rosa, Rui ; Sbragaglia, Valerio ; Sherren, Kate ; Šmejkal, Marek ; Soriano-Redondo, Andrea ; Souza, Allan T ; Wolter, Christian ; Correia, Ricardo A

PLoS biology, 2020-10, Vol.18 (10), p.e3000935 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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10
Enhancing Molecular n‐Type Doping of Donor–Acceptor Copolymers by Tailoring Side Chains
Enhancing Molecular n‐Type Doping of Donor–Acceptor Copolymers by Tailoring Side Chains
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Enhancing Molecular n‐Type Doping of Donor–Acceptor Copolymers by Tailoring Side Chains

Liu, Jian ; Qiu, Li ; Alessandri, Riccardo ; Qiu, Xinkai ; Portale, Giuseppe ; Dong, JingJin ; Talsma, Wytse ; Ye, Gang ; Sengrian, Aprizal Akbar ; Souza, Paulo C. T. ; Loi, Maria Antonietta ; Chiechi, Ryan C. ; Marrink, Siewert J. ; Hummelen, Jan C. ; Koster, L. Jan Anton

Advanced materials (Weinheim), 2018-02, Vol.30 (7), p.n/a [Periódico revisado por pares]

Germany: Wiley Subscription Services, Inc

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