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DNA barcoding in animal species: progress, potential and pitfalls
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DNA barcoding in animal species: progress, potential and pitfalls

Waugh, John

BioEssays, 2007-02, Vol.29 (2), p.188-197 [Periódico revisado por pares]

Hoboken: Wiley Subscription Services, Inc., A Wiley Company

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2
An integrated metagenomics pipeline for strain profiling reveals novel patterns of bacterial transmission and biogeography
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An integrated metagenomics pipeline for strain profiling reveals novel patterns of bacterial transmission and biogeography

Nayfach, Stephen ; Rodriguez-Mueller, Beltran ; Garud, Nandita ; Pollard, Katherine S

Genome research, 2016-11, Vol.26 (11), p.1612-1625 [Periódico revisado por pares]

United States: Cold Spring Harbor Laboratory Press

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3
Comprehensive benchmarking and ensemble approaches for metagenomic classifiers
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Comprehensive benchmarking and ensemble approaches for metagenomic classifiers

McIntyre, Alexa B R ; Ounit, Rachid ; Afshinnekoo, Ebrahim ; Prill, Robert J ; Hénaff, Elizabeth ; Alexander, Noah ; Minot, Samuel S ; Danko, David ; Foox, Jonathan ; Ahsanuddin, Sofia ; Tighe, Scott ; Hasan, Nur A ; Subramanian, Poorani ; Moffat, Kelly ; Levy, Shawn ; Lonardi, Stefano ; Greenfield, Nick ; Colwell, Rita R ; Rosen, Gail L ; Mason, Christopher E

Genome Biology, 2017-09, Vol.18 (1), p.182-182, Article 182 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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4
Anchored Hybrid Enrichment for Massively High-Throughput Phylogenomics
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Anchored Hybrid Enrichment for Massively High-Throughput Phylogenomics

Lemmon, Alan R. ; Emme, Sandra A. ; Lemmon, Emily Moriarty

Systematic biology, 2012-10, Vol.61 (5), p.727-744 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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5
Missed detections of influenza A(H1)pdm09 by real-time RT-PCR assay due to haemagglutinin sequence mutation, December 2017 to March 2018, northern Viet Nam
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Missed detections of influenza A(H1)pdm09 by real-time RT-PCR assay due to haemagglutinin sequence mutation, December 2017 to March 2018, northern Viet Nam

Hoang Vu Mai, Phuong ; Ung Thi Hong, Trang ; Nguyen Le Khanh, Hang ; Nguyen Thanh, Thuy ; Le Thi, Thanh ; Nguyen Vu, Son ; Nguyen Phuong, Anh ; Tran Thi Thu, Huong ; Vuong Duc, Cuong ; Le Quynh, Mai

Western Pacific surveillance and response journal, 2019-01, Vol.10 (1), p.32-38 [Periódico revisado por pares]

Philippines: World Health Organization

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6
Phylogenetic microbiota profiling in fecal samples depends on combination of sequencing depth and choice of NGS analysis method
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Phylogenetic microbiota profiling in fecal samples depends on combination of sequencing depth and choice of NGS analysis method

Rajan, Sukithar K ; Lindqvist, Mårten ; Brummer, Robert Jan ; Schoultz, Ida ; Repsilber, Dirk Ye, Lin

PloS one, 2019-09, Vol.14 (9), p.e0222171-e0222171 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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7
Infectious Disease Dynamics Inferred from Genetic Data via Sequential Monte Carlo
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Infectious Disease Dynamics Inferred from Genetic Data via Sequential Monte Carlo

Smith, R A ; Ionides, E L ; King, A A

Molecular biology and evolution, 2017-08, Vol.34 (8), p.2065-2084 [Periódico revisado por pares]

United States: Oxford University Press

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8
Comparison of three amplicon sequencing approaches to determine staphylococcal populations on human skin
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Comparison of three amplicon sequencing approaches to determine staphylococcal populations on human skin

Ahle, Charlotte Marie ; Stødkilde-Jørgensen, Kristian ; Poehlein, Anja ; Streit, Wolfgang R ; Hüpeden, Jennifer ; Brüggemann, Holger

BMC microbiology, 2021-07, Vol.21 (1), p.221-221, Article 221 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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9
Portable Rabies Virus Sequencing in Canine Rabies Endemic Countries Using the Oxford Nanopore MinION
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Portable Rabies Virus Sequencing in Canine Rabies Endemic Countries Using the Oxford Nanopore MinION

Gigante, Crystal M ; Yale, Gowri ; Condori, Rene Edgar ; Costa, Niceta Cunha ; Long, Nguyen Van ; Minh, Phan Quang ; Chuong, Vo Dinh ; Tho, Nguyen Dang ; Thanh, Nguyen Tat ; Thin, Nguyen Xuan ; Hanh, Nguyen Thi Hong ; Wambura, Gati ; Ade, Frederick ; Mito, Oscar ; Chuchu, Veronicah ; Muturi, Mathew ; Mwatondo, Athman ; Hampson, Katie ; Thumbi, Samuel M ; Thomae, Byron G ; de Paz, Victor Hugo ; Meneses, Sergio ; Munyua, Peninah ; Moran, David ; Cadena, Loren ; Gibson, Andrew ; Wallace, Ryan M ; Pieracci, Emily G ; Li, Yu

Viruses, 2020-11, Vol.12 (11), p.1255 [Periódico revisado por pares]

Switzerland: MDPI

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10
Coxiella burnetii genotyping
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Coxiella burnetii genotyping

Glazunova, Olga ; Roux, Véronique ; Freylikman, Olga ; Sekeyova, Zuzana ; Fournous, Ghislain ; Tyczka, Judith ; Tokarevich, Nikolai ; Kovacava, Elena ; Marrie, Thomas J ; Raoult, Didier

Emerging infectious diseases, 2005-08, Vol.11 (8), p.1211-1217 [Periódico revisado por pares]

United States: U.S. National Center for Infectious Diseases

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