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CLARK: fast and accurate classification of metagenomic and genomic sequences using discriminative k-mers
CLARK: fast and accurate classification of metagenomic and genomic sequences using discriminative k-mers
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CLARK: fast and accurate classification of metagenomic and genomic sequences using discriminative k-mers

Ounit, Rachid ; Wanamaker, Steve ; Close, Timothy J ; Lonardi, Stefano

BMC genomics, 2015-03, Vol.16 (1), p.236-236, Article 236 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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Merqury: reference-free quality, completeness, and phasing assessment for genome assemblies
Merqury: reference-free quality, completeness, and phasing assessment for genome assemblies
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Merqury: reference-free quality, completeness, and phasing assessment for genome assemblies

Rhie, Arang ; Walenz, Brian P ; Koren, Sergey ; Phillippy, Adam M

Genome Biology, 2020-09, Vol.21 (1), p.245-245, Article 245 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central

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General encoding of canonical k-mers
General encoding of canonical k-mers
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General encoding of canonical k-mers

Wittler, Roland

Peer community journal, 2023-09, Vol.3, Article e87 [Periódico revisado por pares]

Peer Community In

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Beyond DNA barcoding: The unrealized potential of genome skim data in sample identification
Beyond DNA barcoding: The unrealized potential of genome skim data in sample identification
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Beyond DNA barcoding: The unrealized potential of genome skim data in sample identification

Bohmann, Kristine ; Mirarab, Siavash ; Bafna, Vineet ; Gilbert, M. Thomas P.

Molecular ecology, 2020-07, Vol.29 (14), p.2521-2534 [Periódico revisado por pares]

England: Blackwell Publishing Ltd

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5
GWAS for genetics of complex quantitative traits: Genome to pangenome and SNPs to SVs and k‐mers
GWAS for genetics of complex quantitative traits: Genome to pangenome and SNPs to SVs and k‐mers
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GWAS for genetics of complex quantitative traits: Genome to pangenome and SNPs to SVs and k‐mers

Gupta, Pushpendra K.

BioEssays, 2021-11, Vol.43 (11), p.e2100109-n/a [Periódico revisado por pares]

Cambridge: Wiley Subscription Services, Inc

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6
A butterfly egg‐killing hypersensitive response in Brassica nigra is controlled by a single locus, PEK, containing a cluster of TIR‐NBS‐LRR receptor genes
A butterfly egg‐killing hypersensitive response in Brassica nigra is controlled by a single locus, PEK, containing a cluster of TIR‐NBS‐LRR receptor genes
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A butterfly egg‐killing hypersensitive response in Brassica nigra is controlled by a single locus, PEK, containing a cluster of TIR‐NBS‐LRR receptor genes

Bassetti, Niccolò ; Caarls, Lotte ; Bouwmeester, Klaas ; Verbaarschot, Patrick ; Eijden, Ewan ; Zwaan, Bas J. ; Bonnema, Guusje ; Schranz, M. Eric ; Fatouros, Nina E.

Plant, cell and environment, 2024-04, Vol.47 (4), p.1009-1022 [Periódico revisado por pares]

United States: Wiley Subscription Services, Inc

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Learning distributed representations of RNA sequences and its application for predicting RNA-protein binding sites with a convolutional neural network
Learning distributed representations of RNA sequences and its application for predicting RNA-protein binding sites with a convolutional neural network
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Learning distributed representations of RNA sequences and its application for predicting RNA-protein binding sites with a convolutional neural network

Pan, Xiaoyong ; Shen, Hong-Bin

Neurocomputing (Amsterdam), 2018-08, Vol.305, p.51-58 [Periódico revisado por pares]

Elsevier B.V

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Estimating the k-mer Coverage Frequencies in Genomic Datasets: A Comparative Assessment of the State-of-the-art
Estimating the k-mer Coverage Frequencies in Genomic Datasets: A Comparative Assessment of the State-of-the-art
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Estimating the k-mer Coverage Frequencies in Genomic Datasets: A Comparative Assessment of the State-of-the-art

Manekar, Swati C ; Sathe, Shailesh R

Current genomics, 2019-01, Vol.20 (1), p.2-15 [Periódico revisado por pares]

United Arab Emirates: Bentham Science Publishers Ltd

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A survey of k-mer methods and applications in bioinformatics
A survey of k-mer methods and applications in bioinformatics
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A survey of k-mer methods and applications in bioinformatics

Camille Moeckel ; Manvita Mareboina ; Maxwell A. Konnaris ; Candace S.Y. Chan ; Ioannis Mouratidis ; Austin Montgomery ; Nikol Chantzi ; Georgios A. Pavlopoulos ; Ilias Georgakopoulos-Soares

Computational and structural biotechnology journal, 2024-12, Vol.23, p.2289-2303 [Periódico revisado por pares]

Elsevier

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KATK: Fast genotyping of rare variants directly from unmapped sequencing reads
KATK: Fast genotyping of rare variants directly from unmapped sequencing reads
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KATK: Fast genotyping of rare variants directly from unmapped sequencing reads

Kaplinski, Lauris ; Möls, Märt ; Puurand, Tarmo ; Pajuste, Fanny‐Dhelia ; Remm, Maido

Human mutation, 2021-06, Vol.42 (6), p.777-786 [Periódico revisado por pares]

United States: Wiley Periodicals Inc

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