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High-quality genome (re)assembly using chromosomal contact data
High-quality genome (re)assembly using chromosomal contact data
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High-quality genome (re)assembly using chromosomal contact data

Marie-Nelly, Hervé ; Marbouty, Martial ; Cournac, Axel ; Flot, Jean-François ; Liti, Gianni ; Parodi, Dante Poggi ; Syan, Sylvie ; Guillén, Nancy ; Margeot, Antoine ; Zimmer, Christophe ; Koszul, Romain

Nature communications, 2014-12, Vol.5 (1), p.5695-5695, Article 5695 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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2
Evolution and comparative genomics of the most common Trichoderma species
Evolution and comparative genomics of the most common Trichoderma species
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Evolution and comparative genomics of the most common Trichoderma species

Kubicek, Christian P ; Steindorff, Andrei S ; Chenthamara, Komal ; Manganiello, Gelsomina ; Henrissat, Bernard ; Zhang, Jian ; Cai, Feng ; Kopchinskiy, Alexey G ; Kubicek, Eva M ; Kuo, Alan ; Baroncelli, Riccardo ; Sarrocco, Sabrina ; Noronha, Eliane Ferreira ; Vannacci, Giovanni ; Shen, Qirong ; Grigoriev, Igor V ; Druzhinina, Irina S

BMC genomics, 2019-06, Vol.20 (1), p.485-485, Article 485 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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3
Cellulases and beyond: the first 70 years of the enzyme producer Trichoderma reesei
Cellulases and beyond: the first 70 years of the enzyme producer Trichoderma reesei
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Cellulases and beyond: the first 70 years of the enzyme producer Trichoderma reesei

Bischof, Robert H ; Ramoni, Jonas ; Seiboth, Bernhard

Microbial cell factories, 2016-06, Vol.15 (1), p.106-106, Article 106 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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4
Genetic engineering of Trichoderma reesei cellulases and their production
Genetic engineering of Trichoderma reesei cellulases and their production
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Genetic engineering of Trichoderma reesei cellulases and their production

Druzhinina, Irina S. ; Kubicek, Christian P.

Microbial biotechnology, 2017-11, Vol.10 (6), p.1485-1499 [Periódico revisado por pares]

United States: John Wiley & Sons, Inc

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5
Trichoderma from Brazilian garlic and onion crop soils and description of two new species: Trichoderma azevedoi and Trichoderma peberdyi
Trichoderma from Brazilian garlic and onion crop soils and description of two new species: Trichoderma azevedoi and Trichoderma peberdyi
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Trichoderma from Brazilian garlic and onion crop soils and description of two new species: Trichoderma azevedoi and Trichoderma peberdyi

Inglis, Peter W ; Mello, Sueli C M ; Martins, Irene ; Silva, João B T ; Macêdo, Kamilla ; Sifuentes, Daniel N ; Valadares-Inglis, M Cleria Morais, Paula V.

PloS one, 2020-03, Vol.15 (3), p.e0228485-e0228485 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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6
Massive lateral transfer of genes encoding plant cell wall-degrading enzymes to the mycoparasitic fungus Trichoderma from its plant-associated hosts
Massive lateral transfer of genes encoding plant cell wall-degrading enzymes to the mycoparasitic fungus Trichoderma from its plant-associated hosts
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Massive lateral transfer of genes encoding plant cell wall-degrading enzymes to the mycoparasitic fungus Trichoderma from its plant-associated hosts

Druzhinina, Irina S ; Chenthamara, Komal ; Zhang, Jian ; Atanasova, Lea ; Yang, Dongqing ; Miao, Youzhi ; Rahimi, Mohammad J ; Grujic, Marica ; Cai, Feng ; Pourmehdi, Shadi ; Salim, Kamariah Abu ; Pretzer, Carina ; Kopchinskiy, Alexey G ; Henrissat, Bernard ; Kuo, Alan ; Hundley, Hope ; Wang, Mei ; Aerts, Andrea ; Salamov, Asaf ; Lipzen, Anna ; LaButti, Kurt ; Barry, Kerrie ; Grigoriev, Igor V ; Shen, Qirong ; Kubicek, Christian P Martin, Francis

PLoS genetics, 2018-04, Vol.14 (4), p.e1007322-e1007322 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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7
Comparative genome sequence analysis underscores mycoparasitism as the ancestral life style of Trichoderma
Comparative genome sequence analysis underscores mycoparasitism as the ancestral life style of Trichoderma
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Comparative genome sequence analysis underscores mycoparasitism as the ancestral life style of Trichoderma

Kubichek, C.P ; Tamayo Ramos, J.A

Genome Biology, 2011-01, Vol.12 (4), p.R40-R40, Article R40 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central

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8
Trichoderma-plant root colonization: escaping early plant defense responses and activation of the antioxidant machinery for saline stress tolerance
Trichoderma-plant root colonization: escaping early plant defense responses and activation of the antioxidant machinery for saline stress tolerance
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Trichoderma-plant root colonization: escaping early plant defense responses and activation of the antioxidant machinery for saline stress tolerance

Brotman, Yariv ; Landau, Udi ; Cuadros-Inostroza, Álvaro ; Tohge, Takayuki ; Takayuki, Tohge ; Fernie, Alisdair R ; Chet, Ilan ; Viterbo, Ada ; Willmitzer, Lothar Howlett, Barbara J.

PLoS pathogens, 2013-03, Vol.9 (3), p.e1003221-e1003221 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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9
Comparative transcriptomics reveals different strategies of Trichoderma mycoparasitism
Comparative transcriptomics reveals different strategies of Trichoderma mycoparasitism
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Comparative transcriptomics reveals different strategies of Trichoderma mycoparasitism

Atanasova, Lea ; Le Crom, Stephane ; Gruber, Sabine ; Coulpier, Fanny ; Seidl-Seiboth, Verena ; Kubicek, Christian P ; Druzhinina, Irina S

BMC genomics, 2013-02, Vol.14 (1), p.121-121 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central

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10
The transcription factor ACE3 controls cellulase activities and lactose metabolism via two additional regulators in the fungus Trichoderma reesei
The transcription factor ACE3 controls cellulase activities and lactose metabolism via two additional regulators in the fungus Trichoderma reesei
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The transcription factor ACE3 controls cellulase activities and lactose metabolism via two additional regulators in the fungus Trichoderma reesei

Zhang, Jiajia ; Chen, Yumeng ; Wu, Chuan ; Liu, Pei ; Wang, Wei ; Wei, Dongzhi

The Journal of biological chemistry, 2019-11, Vol.294 (48), p.18435-18450 [Periódico revisado por pares]

United States: Elsevier Inc

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