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Phase transitions in combinatorial optimization problems basics, algorithms and statistical mechanics
Phase transitions in combinatorial optimization problems basics, algorithms and statistical mechanics
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Phase transitions in combinatorial optimization problems basics, algorithms and statistical mechanics

Alexander K Hartmann Martin Weigt

Weinheim Wiley-VCH 2005

Localização: IFSC - Inst. Física de São Carlos    (530.13 H333p )(Acessar)

2
Improved contact prediction in proteins: using pseudolikelihoods to infer Potts models
Improved contact prediction in proteins: using pseudolikelihoods to infer Potts models
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Improved contact prediction in proteins: using pseudolikelihoods to infer Potts models

Ekeberg, Magnus ; Lövkvist, Cecilia ; Lan, Yueheng ; Weigt, Martin ; Aurell, Erik

Physical review. E, 2013, Vol.87 (1), p.012707-012707, Article 012707 [Periódico revisado por pares]

United States: American Physical Society (APS)

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How Pairwise Coevolutionary Models Capture the Collective Residue Variability in Proteins?
How Pairwise Coevolutionary Models Capture the Collective Residue Variability in Proteins?
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How Pairwise Coevolutionary Models Capture the Collective Residue Variability in Proteins?

Figliuzzi, Matteo ; Barrat-Charlaix, Pierre ; Weigt, Martin

Molecular biology and evolution, 2018-04, Vol.35 (4), p.1018-1027 [Periódico revisado por pares]

United States: Oxford University Press

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4
Inverse statistical physics of protein sequences: a key issues review
Inverse statistical physics of protein sequences: a key issues review
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Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

Inverse statistical physics of protein sequences: a key issues review

Cocco, Simona ; Feinauer, Christoph ; Figliuzzi, Matteo ; Monasson, Rémi ; Weigt, Martin

Reports on Progress in Physics, 2018-03, Vol.81 (3), p.032601-032601 [Periódico revisado por pares]

England: IOP Publishing

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5
On the effect of phylogenetic correlations in coevolution-based contact prediction in proteins
On the effect of phylogenetic correlations in coevolution-based contact prediction in proteins
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Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

On the effect of phylogenetic correlations in coevolution-based contact prediction in proteins

Rodriguez Horta, Edwin ; Weigt, Martin Casadio, Rita

PLoS computational biology, 2021-05, Vol.17 (5), p.e1008957-e1008957 [Periódico revisado por pares]

San Francisco: Public Library of Science

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6
Coevolutionary Landscape Inference and the Context-Dependence of Mutations in Beta-Lactamase TEM-1
Coevolutionary Landscape Inference and the Context-Dependence of Mutations in Beta-Lactamase TEM-1
Material Type:
Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

Coevolutionary Landscape Inference and the Context-Dependence of Mutations in Beta-Lactamase TEM-1

Figliuzzi, Matteo ; Jacquier, Hervé ; Schug, Alexander ; Tenaillon, Oliver ; Weigt, Martin

Molecular biology and evolution, 2016-01, Vol.33 (1), p.268-280 [Periódico revisado por pares]

United States: Oxford Publishing Limited (England)

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7
From principal component to direct coupling analysis of coevolution in proteins: low-eigenvalue modes are needed for structure prediction
From principal component to direct coupling analysis of coevolution in proteins: low-eigenvalue modes are needed for structure prediction
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Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

From principal component to direct coupling analysis of coevolution in proteins: low-eigenvalue modes are needed for structure prediction

Cocco, Simona ; Monasson, Remi ; Weigt, Martin Wallner, Björn

PLoS computational biology, 2013-08, Vol.9 (8), p.e1003176-e1003176 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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8
An evolution-based model for designing chorismate mutase enzymes
An evolution-based model for designing chorismate mutase enzymes
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An evolution-based model for designing chorismate mutase enzymes

Russ, William P ; Figliuzzi, Matteo ; Stocker, Christian ; Barrat-Charlaix, Pierre ; Socolich, Michael ; Kast, Peter ; Hilvert, Donald ; Monasson, Remi ; Cocco, Simona ; Weigt, Martin ; Ranganathan, Rama

Science (American Association for the Advancement of Science), 2020-07, Vol.369 (6502), p.440-445 [Periódico revisado por pares]

United States: The American Association for the Advancement of Science

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9
Efficient generative modeling of protein sequences using simple autoregressive models
Efficient generative modeling of protein sequences using simple autoregressive models
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Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

Efficient generative modeling of protein sequences using simple autoregressive models

Trinquier, Jeanne ; Uguzzoni, Guido ; Pagnani, Andrea ; Zamponi, Francesco ; Weigt, Martin

Nature communications, 2021-10, Vol.12 (1), p.5800-5800, Article 5800 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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10
Structures of a dimodular nonribosomal peptide synthetase reveal conformational flexibility
Structures of a dimodular nonribosomal peptide synthetase reveal conformational flexibility
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Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

Structures of a dimodular nonribosomal peptide synthetase reveal conformational flexibility

Reimer, Janice M ; Eivaskhani, Maximilian ; Harb, Ingrid ; Guarné, Alba ; Weigt, Martin ; Schmeing, T Martin

Science (American Association for the Advancement of Science), 2019-11, Vol.366 (6466) [Periódico revisado por pares]

United States: The American Association for the Advancement of Science

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  1. Hartmann, A
  2. Weigt, M

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