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Interactive metagenomic visualization in a Web browser
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Interactive metagenomic visualization in a Web browser

Ondov, Brian D ; Bergman, Nicholas H ; Phillippy, Adam M

BMC bioinformatics, 2011-09, Vol.12 (1), p.385-385, Article 385 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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iDEP: an integrated web application for differential expression and pathway analysis of RNA-Seq data
iDEP: an integrated web application for differential expression and pathway analysis of RNA-Seq data
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iDEP: an integrated web application for differential expression and pathway analysis of RNA-Seq data

Ge, Steven Xijin ; Son, Eun Wo ; Yao, Runan

BMC bioinformatics, 2018-12, Vol.19 (1), p.534-24, Article 534 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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3
A standardized bacterial taxonomy based on genome phylogeny substantially revises the tree of life
A standardized bacterial taxonomy based on genome phylogeny substantially revises the tree of life
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A standardized bacterial taxonomy based on genome phylogeny substantially revises the tree of life

Parks, Donovan H ; Chuvochina, Maria ; Waite, David W ; Rinke, Christian ; Skarshewski, Adam ; Chaumeil, Pierre-Alain ; Hugenholtz, Philip

Nature biotechnology, 2018-11, Vol.36 (10), p.996-1004 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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4
WGCNA: an R package for weighted correlation network analysis
WGCNA: an R package for weighted correlation network analysis
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WGCNA: an R package for weighted correlation network analysis

Langfelder, Peter ; Horvath, Steve

BMC bioinformatics, 2008-12, Vol.9 (1), p.559-559, Article 559 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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5
Modeling aspects of the language of life through transfer-learning protein sequences
Modeling aspects of the language of life through transfer-learning protein sequences
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Modeling aspects of the language of life through transfer-learning protein sequences

Heinzinger, Michael ; Elnaggar, Ahmed ; Wang, Yu ; Dallago, Christian ; Nechaev, Dmitrii ; Matthes, Florian ; Rost, Burkhard

BMC bioinformatics, 2019-12, Vol.20 (1), p.723-723, Article 723 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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6
CD-HIT: accelerated for clustering the next-generation sequencing data
CD-HIT: accelerated for clustering the next-generation sequencing data
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CD-HIT: accelerated for clustering the next-generation sequencing data

Fu, Limin ; Niu, Beifang ; Zhu, Zhengwei ; Wu, Sitao ; Li, Weizhong

Bioinformatics, 2012-12, Vol.28 (23), p.3150-3152 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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7
GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research—an update
GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research—an update
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GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research—an update

PEAKALL, Rod ; SMOUSE, Peter E

Bioinformatics (Oxford, England), 2012-10, Vol.28 (19), p.2537-2539 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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8
Geneious Basic: An integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data
Geneious Basic: An integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data
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Geneious Basic: An integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data

KEARSE, Matthew ; MOIR, Richard ; THIERER, Tobias ; ASHTON, Bruce ; MEINTJES, Peter ; DRUMMOND, Alexei ; WILSON, Amy ; STONES-HAVAS, Steven ; CHEUNG, Matthew ; STURROCK, Shane ; BUXTON, Simon ; COOPER, Alex ; MARKOWITZ, Sidney ; DURAN, Chris

Bioinformatics (Oxford, England), 2012-06, Vol.28 (12), p.1647-1649 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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9
SINA: Accurate high-throughput multiple sequence alignment of ribosomal RNA genes
SINA: Accurate high-throughput multiple sequence alignment of ribosomal RNA genes
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SINA: Accurate high-throughput multiple sequence alignment of ribosomal RNA genes

PRUESSE, Elmar ; PEPLIES, Jörg ; GLÖCKNER, Frank Oliver

Bioinformatics, 2012-07, Vol.28 (14), p.1823-1829 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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10
Reactome pathway analysis: a high-performance in-memory approach
Reactome pathway analysis: a high-performance in-memory approach
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Reactome pathway analysis: a high-performance in-memory approach

Fabregat, Antonio ; Sidiropoulos, Konstantinos ; Viteri, Guilherme ; Forner, Oscar ; Marin-Garcia, Pablo ; Arnau, Vicente ; D'Eustachio, Peter ; Stein, Lincoln ; Hermjakob, Henning

BMC bioinformatics, 2017-03, Vol.18 (1), p.142-142, Article 142 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central

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