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Protein Data Bank: the single global archive for 3D macromolecular structure data
Protein Data Bank: the single global archive for 3D macromolecular structure data
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Protein Data Bank: the single global archive for 3D macromolecular structure data

Burley, Stephen K ; Berman, Helen M ; Bhikadiya, Charmi ; Bi, Chunxiao ; Chen, Li ; Costanzo, Luigi Di ; Christie, Cole ; Duarte, Jose M ; Dutta, Shuchismita ; Feng, Zukang ; Ghosh, Sutapa ; Goodsell, David S ; Green, Rachel Kramer ; Guranovic, Vladimir ; Guzenko, Dmytro ; Hudson, Brian P ; Liang, Yuhe ; Lowe, Robert ; Peisach, Ezra ; Periskova, Irina ; Randle, Chris ; Rose, Alexander ; Sekharan, Monica ; Shao, Chenghua ; Tao, Yi-Ping ; Valasatava, Yana ; Voigt, Maria ; Westbrook, John ; Young, Jasmine ; Zardecki, Christine ; Zhuravleva, Marina ; Kurisu, Genji ; Nakamura, Haruki ; Kengaku, Yumiko ; Cho, Hasumi ; Sato, Junko ; Kim, Ju Yaen ; Ikegawa, Yasuyo ; Nakagawa, Atsushi ; Yamashita, Reiko ; Kudou, Takahiro ; Bekker, Gert-Jan ; Suzuki, Hirofumi ; Iwata, Takeshi ; Yokochi, Masashi ; Kobayashi, Naohiro ; Fujiwara, Toshimichi ; Velankar, Sameer ; Kleywegt, Gerard J ; Anyango, Stephen ; Armstrong, David R ; Berrisford, John M ; Conroy, Matthew J ; Dana, Jose M ; Deshpande, Mandar ; Gane, Paul ; Gáborová, Romana ; Gupta, Deepti ; Gutmanas, Aleksandras ; Koča, Jaroslav ; Mak, Lora ; Mir, Saqib ; Mukhopadhyay, Abhik ; Nadzirin, Nurul ; Nair, Sreenath ; Patwardhan, Ardan ; Paysan-Lafosse, Typhaine ; Pravda, Lukas ; Salih, Osman ; Sehnal, David ; Varadi, Mihaly ; Vařeková, Radka ; Markley, John L ; Hoch, Jeffrey C ; Romero, Pedro R ; Baskaran, Kumaran ; Maziuk, Dimitri ; Ulrich, Eldon L ; Wedell, Jonathan R ; Yao, Hongyang ; Livny, Miron ; Ioannidis, Yannis E

Nucleic acids research, 2019-01, Vol.47 (D1), p.D520-D528 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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2
Mechanisms of Interplay between Transcription Factors and the 3D Genome
Mechanisms of Interplay between Transcription Factors and the 3D Genome
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Mechanisms of Interplay between Transcription Factors and the 3D Genome

Kim, Seungsoo ; Shendure, Jay

Molecular cell, 2019-10, Vol.76 (2), p.306-319 [Periódico revisado por pares]

United States: Elsevier Inc

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Enhanced sampling techniques in molecular dynamics simulations of biological systems
Enhanced sampling techniques in molecular dynamics simulations of biological systems
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Enhanced sampling techniques in molecular dynamics simulations of biological systems

Bernardi, Rafael C. ; Melo, Marcelo C.R. ; Schulten, Klaus

Biochimica et biophysica acta, 2015-05, Vol.1850 (5), p.872-877 [Periódico revisado por pares]

Netherlands: Elsevier B.V

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AlphaFold Protein Structure Database: massively expanding the structural coverage of protein-sequence space with high-accuracy models
AlphaFold Protein Structure Database: massively expanding the structural coverage of protein-sequence space with high-accuracy models
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AlphaFold Protein Structure Database: massively expanding the structural coverage of protein-sequence space with high-accuracy models

Varadi, Mihaly ; Anyango, Stephen ; Deshpande, Mandar ; Nair, Sreenath ; Natassia, Cindy ; Yordanova, Galabina ; Yuan, David ; Stroe, Oana ; Wood, Gemma ; Laydon, Agata ; Žídek, Augustin ; Green, Tim ; Tunyasuvunakool, Kathryn ; Petersen, Stig ; Jumper, John ; Clancy, Ellen ; Green, Richard ; Vora, Ankur ; Lutfi, Mira ; Figurnov, Michael ; Cowie, Andrew ; Hobbs, Nicole ; Kohli, Pushmeet ; Kleywegt, Gerard ; Birney, Ewan ; Hassabis, Demis ; Velankar, Sameer

Nucleic acids research, 2022-01, Vol.50 (D1), p.D439-D444 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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5
Ultrahigh-resolution centrosymmetric crystal structure of Z-DNA reveals the massive presence of alternate conformations
Ultrahigh-resolution centrosymmetric crystal structure of Z-DNA reveals the massive presence of alternate conformations
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Ultrahigh-resolution centrosymmetric crystal structure of Z-DNA reveals the massive presence of alternate conformations

Drozdzal, Pawel ; Gilski, Miroslaw ; Jaskolski, Mariusz

Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography., 2016-11, Vol.72 (11), p.1203-1211 [Periódico revisado por pares]

5 Abbey Square, Chester, Cheshire CH1 2HU, England: International Union of Crystallography

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6
Integrative, dynamic structural biology at atomic resolution--it's about time
Integrative, dynamic structural biology at atomic resolution--it's about time
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Integrative, dynamic structural biology at atomic resolution--it's about time

van den Bedem, Henry ; Fraser, James S

Nature methods, 2015-04, Vol.12 (4), p.307-318 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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7
The Hitchhiker’s guide to Hi-C analysis: Practical guidelines
The Hitchhiker’s guide to Hi-C analysis: Practical guidelines
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The Hitchhiker’s guide to Hi-C analysis: Practical guidelines

Lajoie, Bryan R. ; Dekker, Job ; Kaplan, Noam

Methods (San Diego, Calif.), 2015-01, Vol.72, p.65-75 [Periódico revisado por pares]

United States: Elsevier Inc

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8
Structure of the dynein-2 complex and its assembly with intraflagellar transport trains
Structure of the dynein-2 complex and its assembly with intraflagellar transport trains
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Structure of the dynein-2 complex and its assembly with intraflagellar transport trains

Toropova, Katerina ; Zalyte, Ruta ; Mukhopadhyay, Aakash G ; Mladenov, Miroslav ; Carter, Andrew P ; Roberts, Anthony J

Nature structural & molecular biology, 2019-09, Vol.26 (9), p.823-829 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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9
CHARMM additive and polarizable force fields for biophysics and computer-aided drug design
CHARMM additive and polarizable force fields for biophysics and computer-aided drug design
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CHARMM additive and polarizable force fields for biophysics and computer-aided drug design

Vanommeslaeghe, K. ; MacKerell, A.D.

Biochimica et biophysica acta, 2015-05, Vol.1850 (5), p.861-871 [Periódico revisado por pares]

Netherlands: Elsevier B.V

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10
Conformational transition of the Ixodes ricinus salivary serpin Iripin‐4
Conformational transition of the Ixodes ricinus salivary serpin Iripin‐4
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Conformational transition of the Ixodes ricinus salivary serpin Iripin‐4

Kascakova, Barbora ; Kotal, Jan ; Havlickova, Petra ; Vopatkova, Vera ; Prudnikova, Tatyana ; Grinkevich, Pavel ; Kuty, Michal ; Chmelar, Jindrich ; Kuta Smatanova, Ivana

Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography., 2023-05, Vol.79 (5), p.409-419 [Periódico revisado por pares]

5 Abbey Square, Chester, Cheshire CH1 2HU, England: International Union of Crystallography

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