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1
Minimap2: pairwise alignment for nucleotide sequences
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Minimap2: pairwise alignment for nucleotide sequences

Li, Heng Birol, Inanc

Bioinformatics, 2018-09, Vol.34 (18), p.3094-3100 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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2
DIABLO: an integrative approach for identifying key molecular drivers from multi-omics assays
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DIABLO: an integrative approach for identifying key molecular drivers from multi-omics assays

Singh, Amrit ; Shannon, Casey P ; Gautier, Benoît ; Rohart, Florian ; Vacher, Michaël ; Tebbutt, Scott J ; Lê Cao, Kim-Anh Birol, Inanc

Bioinformatics (Oxford, England), 2019-09, Vol.35 (17), p.3055-3062 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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3
STREME: accurate and versatile sequence motif discovery
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STREME: accurate and versatile sequence motif discovery

Bailey, Timothy L Birol, Inanc

Bioinformatics (Oxford, England), 2021-09, Vol.37 (18), p.2834-2840 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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4
Genome Detective: an automated system for virus identification from high-throughput sequencing data
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Genome Detective: an automated system for virus identification from high-throughput sequencing data

Vilsker, Michael ; Moosa, Yumna ; Nooij, Sam ; Fonseca, Vagner ; Ghysens, Yoika ; Dumon, Korneel ; Pauwels, Raf ; Alcantara, Luiz Carlos ; Vanden Eynden, Ewout ; Vandamme, Anne-Mieke ; Deforche, Koen ; de Oliveira, Tulio Birol, Inanc

Bioinformatics, 2019-03, Vol.35 (5), p.871-873 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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5
BulkVis: a graphical viewer for Oxford nanopore bulk FAST5 files
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BulkVis: a graphical viewer for Oxford nanopore bulk FAST5 files

Payne, Alexander ; Holmes, Nadine ; Rakyan, Vardhman ; Loose, Matthew Birol, Inanc

Bioinformatics (Oxford, England), 2019-07, Vol.35 (13), p.2193-2198 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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6
M3Drop: dropout-based feature selection for scRNASeq
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M3Drop: dropout-based feature selection for scRNASeq

Andrews, Tallulah S ; Hemberg, Martin Birol, Inanc

Bioinformatics (Oxford, England), 2019-08, Vol.35 (16), p.2865-2867 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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7
ExpansionHunter: a sequence-graph-based tool to analyze variation in short tandem repeat regions
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ExpansionHunter: a sequence-graph-based tool to analyze variation in short tandem repeat regions

Dolzhenko, Egor ; Deshpande, Viraj ; Schlesinger, Felix ; Krusche, Peter ; Petrovski, Roman ; Chen, Sai ; Emig-Agius, Dorothea ; Gross, Andrew ; Narzisi, Giuseppe ; Bowman, Brett ; Scheffler, Konrad ; van Vugt, Joke J F A ; French, Courtney ; Sanchis-Juan, Alba ; Ibáñez, Kristina ; Tucci, Arianna ; Lajoie, Bryan R ; Veldink, Jan H ; Raymond, F Lucy ; Taft, Ryan J ; Bentley, David R ; Eberle, Michael A Birol, Inanc

Bioinformatics, 2019-11, Vol.35 (22), p.4754-4756 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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8
SVIM: structural variant identification using mapped long reads
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SVIM: structural variant identification using mapped long reads

Heller, David ; Vingron, Martin Birol, Inanc

Bioinformatics (Oxford, England), 2019-09, Vol.35 (17), p.2907-2915 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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9
BCFtools/csq: haplotype-aware variant consequences
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BCFtools/csq: haplotype-aware variant consequences

Danecek, Petr ; McCarthy, Shane A Birol, Inanc

Bioinformatics (Oxford, England), 2017-07, Vol.33 (13), p.2037-2039 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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10
ABySS 2.0: resource-efficient assembly of large genomes using a Bloom filter
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ABySS 2.0: resource-efficient assembly of large genomes using a Bloom filter

Jackman, Shaun D ; Vandervalk, Benjamin P ; Mohamadi, Hamid ; Chu, Justin ; Yeo, Sarah ; Hammond, S Austin ; Jahesh, Golnaz ; Khan, Hamza ; Coombe, Lauren ; Warren, Rene L ; Birol, Inanc

Genome research, 2017-05, Vol.27 (5), p.768-777 [Periódico revisado por pares]

United States: Cold Spring Harbor Laboratory Press

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