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Cd-hit: a fast program for clustering and comparing large sets of protein or nucleotide sequences
Cd-hit: a fast program for clustering and comparing large sets of protein or nucleotide sequences
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Cd-hit: a fast program for clustering and comparing large sets of protein or nucleotide sequences

Li, Weizhong ; Godzik, Adam

Bioinformatics, 2006-07, Vol.22 (13), p.1658-1659 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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COPASI—a COmplex PAthway SImulator
COPASI—a COmplex PAthway SImulator
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COPASI—a COmplex PAthway SImulator

Hoops, Stefan ; Sahle, Sven ; Gauges, Ralph ; Lee, Christine ; Pahle, Jürgen ; Simus, Natalia ; Singhal, Mudita ; Xu, Liang ; Mendes, Pedro ; Kummer, Ursula

Bioinformatics, 2006-12, Vol.22 (24), p.3067-3074 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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Blast2GO: a universal tool for annotation, visualization and analysis in functional genomics research
Blast2GO: a universal tool for annotation, visualization and analysis in functional genomics research
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Blast2GO: a universal tool for annotation, visualization and analysis in functional genomics research

Conesa, Ana ; Götz, Stefan ; García-Gómez, Juan Miguel ; Terol, Javier ; Talón, Manuel ; Robles, Montserrat

Bioinformatics, 2005-09, Vol.21 (18), p.3674-3676 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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Pvclust: an R package for assessing the uncertainty in hierarchical clustering
Pvclust: an R package for assessing the uncertainty in hierarchical clustering
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Pvclust: an R package for assessing the uncertainty in hierarchical clustering

Suzuki, Ryota ; Shimodaira, Hidetoshi

Bioinformatics, 2006-06, Vol.22 (12), p.1540-1542 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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SNPStats: a web tool for the analysis of association studies
SNPStats: a web tool for the analysis of association studies
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SNPStats: a web tool for the analysis of association studies

Solé, Xavier ; Guinó, Elisabet ; Valls, Joan ; Iniesta, Raquel ; Moreno, Víctor

Bioinformatics, 2006-08, Vol.22 (15), p.1928-1929 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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Bio3d: an R package for the comparative analysis of protein structures
Bio3d: an R package for the comparative analysis of protein structures
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Bio3d: an R package for the comparative analysis of protein structures

Grant, Barry J. ; Rodrigues, Ana P. C. ; ElSawy, Karim M. ; McCammon, J. Andrew ; Caves, Leo S. D.

Bioinformatics, 2006-11, Vol.22 (21), p.2695-2696 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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7
Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure
Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure
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Improved scoring of functional groups from gene expression data by decorrelating GO graph structure

Alexa, Adrian ; Rahnenführer, Jörg ; Lengauer, Thomas

Bioinformatics, 2006-07, Vol.22 (13), p.1600-1607 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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BiNGO: a Cytoscape plugin to assess overrepresentation of Gene Ontology categories in Biological Networks
BiNGO: a Cytoscape plugin to assess overrepresentation of Gene Ontology categories in Biological Networks
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BiNGO: a Cytoscape plugin to assess overrepresentation of Gene Ontology categories in Biological Networks

Maere, Steven ; Heymans, Karel ; Kuiper, Martin

Bioinformatics, 2005-08, Vol.21 (16), p.3448-3449 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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9
Automated genome annotation and pathway identification using the KEGG Orthology (KO) as a controlled vocabulary
Automated genome annotation and pathway identification using the KEGG Orthology (KO) as a controlled vocabulary
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Automated genome annotation and pathway identification using the KEGG Orthology (KO) as a controlled vocabulary

Mao, Xizeng ; Cai, Tao ; Olyarchuk, John G. ; Wei, Liping

Bioinformatics, 2005-10, Vol.21 (19), p.3787-3793 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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10
TimeTree: a public knowledge-base of divergence times among organisms
TimeTree: a public knowledge-base of divergence times among organisms
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TimeTree: a public knowledge-base of divergence times among organisms

Hedges, S. Blair ; Dudley, Joel ; Kumar, Sudhir

Bioinformatics, 2006-12, Vol.22 (23), p.2971-2972 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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