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Snakemake—a scalable bioinformatics workflow engine
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Snakemake—a scalable bioinformatics workflow engine

KÖSTER, Johannes ; RAHMANN, Sven

Bioinformatics (Oxford, England), 2012-10, Vol.28 (19), p.2520-2522 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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42
DNABERT: pre-trained Bidirectional Encoder Representations from Transformers model for DNA-language in genome
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DNABERT: pre-trained Bidirectional Encoder Representations from Transformers model for DNA-language in genome

Ji, Yanrong ; Zhou, Zhihan ; Liu, Han ; Davuluri, Ramana V Kelso, Janet

Bioinformatics (Oxford, England), 2021-08, Vol.37 (15), p.2112-2120 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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43
Molecular signatures database (MSigDB) 3.0
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Molecular signatures database (MSigDB) 3.0

LIBERZON, Arthur ; SUBRAMANIAN, Aravind ; PINCHBACK, Reid ; THORVALDSDOTTIR, Helga ; TAMAYO, Pablo ; MESIROV, Jill P

Bioinformatics (Oxford, England), 2011-06, Vol.27 (12), p.1739-1740 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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44
PhenoScanner V2: an expanded tool for searching human genotype–phenotype associations
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PhenoScanner V2: an expanded tool for searching human genotype–phenotype associations

Kamat, Mihir A ; Blackshaw, James A ; Young, Robin ; Surendran, Praveen ; Burgess, Stephen ; Danesh, John ; Butterworth, Adam S ; Staley, James R Kelso, Janet

Bioinformatics, 2019-11, Vol.35 (22), p.4851-4853 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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45
Strelka: accurate somatic small-variant calling from sequenced tumor―normal sample pairs
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Strelka: accurate somatic small-variant calling from sequenced tumor―normal sample pairs

SAUNDERS, Christopher T ; WONG, Wendy S. W ; SWAMY, Sajani ; BECQ, Jennifer ; MURRAY, Lisa J ; CHEETHAM, R. Keira

Bioinformatics, 2012-07, Vol.28 (14), p.1811-1817 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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46
Cooler: scalable storage for Hi-C data and other genomically labeled arrays
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Cooler: scalable storage for Hi-C data and other genomically labeled arrays

Abdennur, Nezar ; Mirny, Leonid A Wren, Jonathan

Bioinformatics, 2020-01, Vol.36 (1), p.311-316 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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47
adegenet 1.3-1: new tools for the analysis of genome-wide SNP data
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adegenet 1.3-1: new tools for the analysis of genome-wide SNP data

Jombart, Thibaut ; Ahmed, Ismaïl

Bioinformatics, 2011-11, Vol.27 (21), p.3070-3071 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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48
IRscope: an online program to visualize the junction sites of chloroplast genomes
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IRscope: an online program to visualize the junction sites of chloroplast genomes

Amiryousefi, Ali ; Hyvönen, Jaakko ; Poczai, Peter Hancock, John

Bioinformatics, 2018-09, Vol.34 (17), p.3030-3031 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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49
DIABLO: an integrative approach for identifying key molecular drivers from multi-omics assays
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DIABLO: an integrative approach for identifying key molecular drivers from multi-omics assays

Singh, Amrit ; Shannon, Casey P ; Gautier, Benoît ; Rohart, Florian ; Vacher, Michaël ; Tebbutt, Scott J ; Lê Cao, Kim-Anh Birol, Inanc

Bioinformatics (Oxford, England), 2019-09, Vol.35 (17), p.3055-3062 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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50
Bismark: a flexible aligner and methylation caller for Bisulfite-Seq applications
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Bismark: a flexible aligner and methylation caller for Bisulfite-Seq applications

KRUEGER, Felix ; ANDREWS, Simon R

Bioinformatics, 2011-06, Vol.27 (11), p.1571-1572 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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