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MICAN : a protein structure alignment algorithm that can handle Multiple-chains, Inverse alignments, C α only models, Alternative alignments, and Non-sequential alignments
MICAN : a protein structure alignment algorithm that can handle Multiple-chains, Inverse alignments, C α only models, Alternative alignments, and Non-sequential alignments
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MICAN : a protein structure alignment algorithm that can handle Multiple-chains, Inverse alignments, C α only models, Alternative alignments, and Non-sequential alignments

Minami, Shintaro ; Sawada, Kengo ; Chikenji, George

BMC bioinformatics, 2013-01, Vol.14 (1), p.24-24, Article 24 [Periódico revisado por pares]

BioMed Central Ltd

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2
Minimap2: pairwise alignment for nucleotide sequences
Minimap2: pairwise alignment for nucleotide sequences
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Minimap2: pairwise alignment for nucleotide sequences

Li, Heng Birol, Inanc

Bioinformatics, 2018-09, Vol.34 (18), p.3094-3100 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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3
The Sequence Alignment/Map format and SAMtools
The Sequence Alignment/Map format and SAMtools
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The Sequence Alignment/Map format and SAMtools

Li, Heng ; Handsaker, Bob ; Wysoker, Alec ; Fennell, Tim ; Ruan, Jue ; Homer, Nils ; Marth, Gabor ; Abecasis, Goncalo ; Durbin, Richard

Bioinformatics, 2009-08, Vol.25 (16), p.2078-2079 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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4
Petabase-scale sequence alignment catalyses viral discovery
Petabase-scale sequence alignment catalyses viral discovery
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Petabase-scale sequence alignment catalyses viral discovery

Edgar, Robert C ; Taylor, Jeff ; Lin, Victor ; Altman, Tomer ; Barbera, Pierre ; Meleshko, Dmitry ; Lohr, Dan ; Novakovsky, Gherman ; Buchfink, Benjamin ; Al-Shayeb, Basem ; Banfield, Jillian F ; de la Peña, Marcos ; Korobeynikov, Anton ; Chikhi, Rayan ; Babaian, Artem

Nature (London), 2022-02, Vol.602 (7895), p.142-147 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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5
Fast and sensitive protein alignment using DIAMOND
Fast and sensitive protein alignment using DIAMOND
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Fast and sensitive protein alignment using DIAMOND

Buchfink, Benjamin ; Xie, Chao ; Huson, Daniel H

Nature methods, 2015-01, Vol.12 (1), p.59-60 [Periódico revisado por pares]

United States: Nature Publishing Group

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6
A simple method to control over-alignment in the MAFFT multiple sequence alignment program
A simple method to control over-alignment in the MAFFT multiple sequence alignment program
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A simple method to control over-alignment in the MAFFT multiple sequence alignment program

Katoh, Kazutaka ; Standley, Daron M

Bioinformatics, 2016-07, Vol.32 (13), p.1933-1942 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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7
SOAP: short oligonucleotide alignment program
SOAP: short oligonucleotide alignment program
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SOAP: short oligonucleotide alignment program

Li, Ruiqiang ; Li, Yingrui ; Kristiansen, Karsten ; Wang, Jun

Bioinformatics, 2008-03, Vol.24 (5), p.713-714 [Periódico revisado por pares]

Oxford: Oxford University Press

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8
Data-driven network alignment
Data-driven network alignment
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Artigo 		Adicionar ao Meu Espaço

Data-driven network alignment

Gu, Shawn ; Milenkovic, Tijana ; Cannistraci, Carlo Vittorio Cannistraci, Carlo Vittorio

PloS one, 2020-07, Vol.15 (7), p.e0234978-e0234978 [Periódico revisado por pares]

San Francisco: Public Library of Science

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9
Sambamba: fast processing of NGS alignment formats
Sambamba: fast processing of NGS alignment formats
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Sambamba: fast processing of NGS alignment formats

Tarasov, Artem ; Vilella, Albert J ; Cuppen, Edwin ; Nijman, Isaac J ; Prins, Pjotr

Bioinformatics (Oxford, England), 2015-06, Vol.31 (12), p.2032-2034 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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10
New strategies to improve minimap2 alignment accuracy
New strategies to improve minimap2 alignment accuracy
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New strategies to improve minimap2 alignment accuracy

Li, Heng Alkan, Can

Bioinformatics, 2021-12, Vol.37 (23), p.4572-4574 [Periódico revisado por pares]

England: Oxford University Press

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  8. Bmc Bioinformatics  (4.308)
  9. Plos Pathogens  (3.879)
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