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Critical assessment of methods of protein structure prediction (CASP)—Round XIV
Critical assessment of methods of protein structure prediction (CASP)—Round XIV
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Critical assessment of methods of protein structure prediction (CASP)—Round XIV

Kryshtafovych, Andriy ; Schwede, Torsten ; Topf, Maya ; Fidelis, Krzysztof ; Moult, John

Proteins, structure, function, and bioinformatics, 2021-12, Vol.89 (12), p.1607-1617 [Periódico revisado por pares]

Hoboken, USA: John Wiley & Sons, Inc

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2
Applying and improving AlphaFold at CASP14
Applying and improving AlphaFold at CASP14
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Applying and improving AlphaFold at CASP14

Jumper, John ; Evans, Richard ; Pritzel, Alexander ; Green, Tim ; Figurnov, Michael ; Ronneberger, Olaf ; Tunyasuvunakool, Kathryn ; Bates, Russ ; Žídek, Augustin ; Potapenko, Anna ; Bridgland, Alex ; Meyer, Clemens ; Kohl, Simon A. A. ; Ballard, Andrew J. ; Cowie, Andrew ; Romera‐Paredes, Bernardino ; Nikolov, Stanislav ; Jain, Rishub ; Adler, Jonas ; Back, Trevor ; Petersen, Stig ; Reiman, David ; Clancy, Ellen ; Zielinski, Michal ; Steinegger, Martin ; Pacholska, Michalina ; Berghammer, Tamas ; Silver, David ; Vinyals, Oriol ; Senior, Andrew W. ; Kavukcuoglu, Koray ; Kohli, Pushmeet ; Hassabis, Demis

Proteins, structure, function, and bioinformatics, 2021-12, Vol.89 (12), p.1711-1721 [Periódico revisado por pares]

Hoboken, USA: John Wiley & Sons, Inc

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3
The trRosetta server for fast and accurate protein structure prediction
The trRosetta server for fast and accurate protein structure prediction
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The trRosetta server for fast and accurate protein structure prediction

Du, Zongyang ; Su, Hong ; Wang, Wenkai ; Ye, Lisha ; Wei, Hong ; Peng, Zhenling ; Anishchenko, Ivan ; Baker, David ; Yang, Jianyi

Nature protocols, 2021-12, Vol.16 (12), p.5634-5651 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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4
RNA recognition by double-stranded RNA binding domains: a matter of shape and sequence
RNA recognition by double-stranded RNA binding domains: a matter of shape and sequence
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RNA recognition by double-stranded RNA binding domains: a matter of shape and sequence

Masliah, Grégoire ; Barraud, Pierre ; Allain, Frédéric H. -T.

Cellular and molecular life sciences : CMLS, 2013-06, Vol.70 (11), p.1875-1895 [Periódico revisado por pares]

Basel: SP Birkhäuser Verlag Basel

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5
ClipKIT: A multiple sequence alignment trimming software for accurate phylogenomic inference
ClipKIT: A multiple sequence alignment trimming software for accurate phylogenomic inference
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ClipKIT: A multiple sequence alignment trimming software for accurate phylogenomic inference

Steenwyk, Jacob L ; Buida, 3rd, Thomas J ; Li, Yuanning ; Shen, Xing-Xing ; Rokas, Antonis Hejnol, Andreas

PLoS Biology, 2020-12, Vol.18 (12), p.e3001007-e3001007 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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6
Modeling aspects of the language of life through transfer-learning protein sequences
Modeling aspects of the language of life through transfer-learning protein sequences
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Modeling aspects of the language of life through transfer-learning protein sequences

Heinzinger, Michael ; Elnaggar, Ahmed ; Wang, Yu ; Dallago, Christian ; Nechaev, Dmitrii ; Matthes, Florian ; Rost, Burkhard

BMC bioinformatics, 2019-12, Vol.20 (1), p.723-723, Article 723 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central Ltd

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7
I-TASSER: a unified platform for automated protein structure and function prediction
I-TASSER: a unified platform for automated protein structure and function prediction
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I-TASSER: a unified platform for automated protein structure and function prediction

Zhang, Yang ; Roy, Ambrish ; Kucukural, Alper

Nature protocols, 2010-04, Vol.5 (4), p.725-738 [Periódico revisado por pares]

England: Nature Publishing Group

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8
Three-Dimensional Structures of Membrane Proteins from Genomic Sequencing
Three-Dimensional Structures of Membrane Proteins from Genomic Sequencing
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Three-Dimensional Structures of Membrane Proteins from Genomic Sequencing

Hopf, Thomas A. ; Colwell, Lucy J. ; Sheridan, Robert ; Rost, Burkhard ; Sander, Chris ; Marks, Debora S.

Cell, 2012-06, Vol.149 (7), p.1607-1621 [Periódico revisado por pares]

United States: Elsevier Inc

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9
Sequence-based prediction of protein protein interaction using a deep-learning algorithm
Sequence-based prediction of protein protein interaction using a deep-learning algorithm
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Sequence-based prediction of protein protein interaction using a deep-learning algorithm

Sun, Tanlin ; Zhou, Bo ; Lai, Luhua ; Pei, Jianfeng

BMC bioinformatics, 2017-05, Vol.18 (1), p.277-277, Article 277 [Periódico revisado por pares]

England: BioMed Central

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10
Why do eukaryotic proteins contain more intrinsically disordered regions?
Why do eukaryotic proteins contain more intrinsically disordered regions?
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Why do eukaryotic proteins contain more intrinsically disordered regions?

Basile, Walter ; Salvatore, Marco ; Bassot, Claudio ; Elofsson, Arne Wilke, Claus O.

PLoS computational biology, 2019-07, Vol.15 (7), p.e1007186-e1007186 [Periódico revisado por pares]

United States: Public Library of Science

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