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Modelagem quântica de inibidores enzimáticos.

Trzesniak, Daniel Rodrigo Ferreira

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Instituto de Física 2002-04-23

Acesso online. A biblioteca também possui exemplares impressos.

  • Título:
    Modelagem quântica de inibidores enzimáticos.
  • Autor: Trzesniak, Daniel Rodrigo Ferreira
  • Orientador: Canuto, Sylvio Roberto Accioly
  • Assuntos: Modelagem Teórica; Espectroscopia; Inibidores Enzimáticos; Mecânica Quântica; Química Computacional; Spectroscopy; Quantum Mechanics; Computational Chemistry; Enzimatic Inhibitors; Theoretical Modelling
  • Notas: Dissertação (Mestrado)
  • Descrição: Realizamos uma caracterização estrutural e eletrônica dos inibidores enzimáticos E-64 e CA030 utilizando técnicas de química quântica. Otimizações de geometria são realizadas em nível ab initio com os métodos Hartree-Fock e Teoria do Funcional da Densidade e estas estruturas são então comparadas com os resultados cristalográficos obtidos do Protein Data Bank. O cálculo do espectro de vibração infravermelho foi realizado para assegurar que as estruturas eram pontos de mínimo. Nós também fizemos a atribuição das freqüências vibracionais aos grupos funcionais das moléculas. A caracterização eletrônica é obtida com o cálculo do espectro de absorção ultravioleta-visível. Efeitos de solvente são contabilizados através da teoria de Campo de Reação Auto-Consistente. Uma análise detalhada das excitações do espectro calculado do E-64 e do CA030 é realizada e nós estudamos particularmente as transições características em torno de 200 nm. Tanto para o E-64 como para o CA030 nós identificamos o cromóforo responsável pela transição característica dos inibidores. Adicionalmente, nós levamos em consideração a influência da interação do CA030 com a catepsina B através do cálculo do espectro ultravioleta-visível do inibidor com o aminoácido cisteína.
  • DOI: 10.11606/D.43.2002.tde-26062002-143722
  • Editor: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Instituto de Física
  • Data de criação/publicação: 2002-04-23
  • Formato: Adobe PDF
  • Idioma: Português
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