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Tipagem molecular de escherichia coli enteropatogênica por seqüenciamento de multilocus

André Pitondo da Silva Marcelo Brocchi

2007

Localização: FMRP - Fac. Medicina de Ribeirão Preto    (Silva, Andr Pitondo da )(Acessar)

  • Título:
    Tipagem molecular de escherichia coli enteropatogênica por seqüenciamento de multilocus
  • Autor: André Pitondo da Silva
  • Marcelo Brocchi
  • Assuntos: BIOLOGIA MOLECULAR; BIOLOGIA CELULAR; BACTERIOLOGIA
  • Notas: Tese (Doutorado)
  • Descrição: scherichia coli enteropatogênica (EPEC) é a principal bactéria causadora de diarréia infantil e é responsável por alta mortalidade em crianças menores que dois anos de idade nos paises em desenvolvimento. As técnicas moleculares vêm se tornando ferramentas importantes para a melhor compreensão dos processos infecciosos e epidemiológicos destas bactérias. A recente técnica de tipagem por seqüenciamento por multilocus (MLST, do inglês mutilocus sequence typíng), baseada na análise de genes bacterianos de manutenção, tem se mostrado importante na caracterização de espécies bacterianas. Esta técnica tem a vantagem de ser altamente reprodutiva e os resultados podem ser compartilhados online, entre países do mundo todo. MLST tem sido pouco explorada em estudos epidemiológicos e filogenéticos envolvendo linhagens de EPEC, particularmente no Brasil. Havia no banco de dados de MLST de E. coli apenas 23 linhagens registradas da América do Sul. Este estudo incluiu outras 30 linhagens de EPEC, previamente analisadas e classificadas por técnicas sorológicas (antígenos O e H) e molecular (PFGE, do inglês Pulsed-field gel electrophoresis). Seis novos alelos foram encontrados, os quais determinaram 14 novos "Sequence Types" (STs) em 18 linhagens (60%). Doze linhagens foram associadas com 8 STs já descritos. Assim, as linhagens foram divididas em 12 complexos clonais (CC), sendo o maior deles o CC10, do qual pertencem 3 linhagens do estudo e outras 9 brasileiras, indicando uma
    prevalência endêmica destes clones no país. Os genes housekeepíng purA e reGA apresentaram menor variação em relação aos demais (adk, fumC, gyrB, icd e mdh). Dezoito linhagens (60%) do estudo são EPEC atípicas e não foi possível, determinar por MLST, relações genéticas entre as EPEC típicas e atípicas, nem mesmo entre EPEC atípicas com EHEC e EAEC. Assim como PFGE, MLST mostrou ser uma técnica de tipagem com tendência para discriminação de sorotipos de EPEC, porém não eficiente. Este estudo permitiu incluir dados do Brasil, no banco de dados de MLST de E. coli, visto que os dados originados destas regiões eram praticamente inexistentes, pem1itindo, desta maneira, análise das linhagens de E. coli isoladas no Brasil, em relação às isoladas no mundo todo
  • Data de criação/publicação: 2007
  • Formato: 93 p. anexos.
  • Idioma: Português
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