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Métodos Clássicos e Quânticos no Estudo de Geometrias de Moléculas Biológicas

Ota, André Tsutomu

Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Instituto de Física 1997-09-30

Acesso online. A biblioteca também possui exemplares impressos.

  • Título:
    Métodos Clássicos e Quânticos no Estudo de Geometrias de Moléculas Biológicas
  • Autor: Ota, André Tsutomu
  • Orientador: Ito, Amando Siuiti; Loos, Michel
  • Assuntos: Estrutura Eletrônica; Matéria Condensada; Condensed Matter; Electronic Structure
  • Notas: Tese (Doutorado)
  • Descrição: Duas são as principais características deste trabalho. A primeira é a introdução de um método para o cálculo da energia livre absoluta no programa de dinâmica molecular clássica Thor. Este método é geral e pode ser usado no vácuo ou em solução,sob quaisquer condições de pressão e/ou temperatura. Trata-se de um caso especial de integração termodinâmica para cálculos de energia livre, e compara um estado termodinâmico com um sistema modelo para o qual a energia livre é conhecidaanaliticamente. O estado modelo é conhecido no início, e após uma integração termodinâmica até o estado real final, a energia livre absoluta é calculada como uma soma desta integração mais a energia livre do estado modelo. A energia livredepende do modelo a partir do qual a função de partição é derivada analiticamente. O modelo definido é o sólido de Einstein. Os átomos deste sólido ideal não interagem entre si (como um gás ideal) e estão ligados harmonicamente às suas posiçõesideais. O acoplamento entre os dois estados é feito.
  • DOI: 10.11606/T.43.1997.tde-27022014-162732
  • Editor: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP; Universidade de São Paulo; Instituto de Física
  • Data de criação/publicação: 1997-09-30
  • Formato: Adobe PDF
  • Idioma: Português
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  • Realização: ABCD-USP USP   Logos de Redes Sociais: Freepik

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